微生物多样性测序三代全长扩增子5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in宏基因组测序三代宏基因组宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因分析宏基因组元素循环分析高宿主污染去除宏基因组项目宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序高通量16S rDNA菌种鉴定三代DNA宏病毒组MIG-seq肠道宏基因组绝对定量多营养级扩增子扩增子双因素分析动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱eQTL简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序三代重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序mGWASMeta-Barcoding(eDNA)技术研究种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序定制生信分析服务器数据库开发构建服务高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学10×单细胞核转录组10×单细胞转录组华大Stereo-seq空间转录组测序DNBelab C-TaiM4单细胞核转录组DNBelab C-TaiM4单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析微课云交付平台扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表

产品介绍

传统Bulk RNA-seq仅能呈现组织整体的平均基因表达水平,无法区分不同区域的分子差异。而单细胞 RNA-seqscRNA-seq)虽能解析细胞异质性,却因丢失细胞在组织中的空间位置信息,难以揭示 “基因表达与组织微结构、细胞功能定位” 的关联 —— 例如肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞的空间邻域关系、脑组织中神经元亚型的区域分布规律、发育组织中基因表达的空间梯度变化等关键科学问题,均需 “基因表达 + 空间位置” 的双重信息才能解答。

华大自主研发的Stereo-seqSpatially Resolved Transcriptomics Sequencing,空间分辨转录组测序) 技术,依托 “超高分辨率空间芯片 + 高通量测序” 的核心体系,实现了 “单细胞级分辨率” 与 “组织全局视野” 的结合,可精准捕获组织切片中每个位点的基因表达信息,并将其映射回原始组织的空间位置,完美解决 “基因在哪表达” 的核心痛点。该技术已广泛应用于肿瘤微环境解析、神经科学图谱绘制、发育生物学时空轨迹追踪、临床病理分子分型等领域,为生命科学研究提供 “空间维度” 的全新视角。

空间转录组Stereo-seq分析原理

华大 Stereo-seq 的核心技术是:“空间磁珠阵列(Spatial Bead Array)+ 空间条形码(Spatial Barcode体系,通过位置已知的分子标记实现基因表达与空间坐标的精准关联,具体原理如下:

  • Stereo-seq芯片上布满了数十亿规则阵列排布的单链线球状DNA纳米球(DNA NanoBall DNB)。DNB是以单链环状DNA为模版,经过滚环扩增得到的产物,每个DNB直径为220nm,两个DNB中心点间距范围为500nm

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  • 通过DNBSEQ技术对固定在芯片上的DNB进行测序,得到Coordinate ID(CID)信息,CIDDNB坐标位置一一对应,可以通过建立CID与坐标位置的映射关系,还原后续捕获到的mRNA的空间为止。

  • DNBStereo-seq生物方法合成携带CIDDNB后链接分子编码(Molecular IDMID用于区分不同转录本)和Poly T序列,后续可以实现对游离mRNA的捕获。

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  • 标准Stereo-seq文库的CID序列长度为25bpMID长度为10bp。文库结构如下:

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  • 然后进行对文库测序,最后进行空间分辨转录组图谱构建。

技术优势

1、项目经验丰富:Stereo-seq平台已研究物种超过70种,样本类型超过150支持新鲜冰冻的各种组织类型样本。

2、性价比之王:国产平台使得科研成本更低,研究范围更加广泛

3、优秀的本地化服务团队凌恩生物拥有经验丰富的实验-分析-售后团队,一站式服务,响应及时使科研机构能够获得更灵活的技术响应、更低廉的服务成本和更安全的数据保障。

4、华大Stereo-seq技术加持,超高分辨率成像,可实现空间单细胞水平分析。


送样要求

OTC包埋的动物组织,干冰运输。具体请参考送样指南。

分析示例

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