微生物多样性测序三代全长扩增子5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in宏基因组测序三代宏基因组宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因分析宏基因组元素循环分析高宿主污染去除宏基因组项目宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序高通量16S rDNA菌种鉴定三代DNA宏病毒组MIG-seq肠道宏基因组绝对定量多营养级扩增子扩增子双因素分析动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱eQTL简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序三代重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序mGWASMeta-Barcoding(eDNA)技术研究种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序定制生信分析服务器数据库开发构建服务高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学10×单细胞核转录组10×单细胞转录组华大Stereo-seq空间转录组测序DNBelab C-TaiM4单细胞核转录组DNBelab C-TaiM4单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析微课云交付平台扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表

产品介绍

单细胞核转录组测序(single-nucleus RNA-seq,snRNA-seq)是针对单个细胞核内的转录本进行扩增和高通量测序的一项新技术。该技术可以精准获得每个细胞的表达谱特征,揭示细胞异质性,发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能,对深入了解样本中细胞间的类型划分和相互作用意义深远,是研究细胞基因表达异质性、发育分化过程、机制研究、环境响应、医学及农业育种等的重要手段。


分析原理

DNBelab C-TaiM4单细胞3’转录组产品采用液滴微流控原理,将带有标签引物的捕获磁珠体系和单个细胞核体系包裹在油相液滴中;与传统GEMs体系不同的是,C-TaiM4采用双微珠捕获识别实现对polyA结构的mRNA进行充分捕获:Cell Beads用于mRNA的捕获,Index Carrier微珠用于根据同液滴中带有相似标签引物的强相关性识别、合并Cell Beads,提升有效液滴数量。

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图 DNBelab C-TaiM4单细胞平台实验原理


实验流程

从细胞核样品提取到最终数据获得,样品检测、建库、测序等每一环节都会直接影响数据的数量和质量,从而影响后续信息分析的结果。为从源头保证测序数据准确可靠,凌恩生物承诺在项目所有生产环节都严格把关,从根源上确保高质量数据的产出。单细胞核转录组整体实验流程图如下:

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图 单细胞核转录组测序实验流程


技术流程


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技术优势

1. 样本兼容性广泛:包含动物及植物细胞核样本,可适用于冻存样本以及直径较大的细胞。

2. 低多胞率:1,000细胞/0.4%。

3. 实验稳定性良好:批次间差异较小,重复性佳。

4. 数据质量卓越:通过直接抽核,有效降低细胞偏好性,能够捕获稀有细胞以及新的 Marker 基因。同时,避免了酶消化应激,完整保留转录本异构体信息

5. 性价比高:在同等经费条件下,大队列研究可纳入更多样本。


送样要求


1、脑、心脏、肌肉等含有直径大于40μm细胞的组织类型,关注肝实质细胞、肾小球足细胞等特殊细胞的组织类型

2、送-80℃冷冻保存或过液氮的组织或细胞。建议冻存时间不宜过长。

3、组织或细胞送样量的要求:送200mg或以上,大小为0.5cm3


分析示例


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凌恩生物人&动物&植物单细胞项目经验

(部分数据)


物种

样本类型

项目类型

小鼠

脑、肠道、肿瘤、海马体、肾脏、皮肤等组织

抽核

精索静脉、肝星状细胞

抽核

中华管鞭虾

肝胰腺、胃、肠、肌肉

解离+抽核

主要模式植物

小麦茎和叶片、棉花、白菜茎尖、大豆根瘤、拟南芥根和叶、番茄果实、水稻花穗、甘蓝根和叶

抽核

昆虫

松材线虫虫体

抽核

其他

大黄鱼肝脏、尼罗罗非鱼鳃、羊胎盘、中华鳖卵巢和精巢、红九棘鲈胚胎、绵羊肌肉和其胚胎肌肉

抽核