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产品介绍 mGWAS(microbiome Genome-Wide Association Study)，是将GWAS与微生物群落进行关联分析。是以微生物群落的数据作为表型，与基因组SNP数据进行关联分析，帮助人们更好地理解宿主和微生物以及表型性状之间的相互作用机制，以及遗传因素对微生物群落的影响。 分析流程
技术特色 1.多组学整合分析平台：采用"宿主WGS+宏基因组" 多维数据整合策略，全面解析宿主—微生物互作关系。 2.单核苷酸多态性（SNP）关联分析：可以精准定位到宿主基因组中与微生物相关的特定遗传位点。 3.构建复杂关联网络：基于大量的关联分析结果，构建宿主基因与微生物群落之间的复杂关联网络。
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本研究通过分析126 个福尼奥种质的种子微生物组，研究发现，尽管来自不同地理位置的fonio种质具有独特的微生物组，但它们共享一个核心微生物群。土壤成分、地理气候因素和宿主基因型共同影响了种子微生物组的组成。通过全基因组关联分析（GWAS），作者鉴定出与微生物组多样性相关的遗传位点，这些位点涉及胚胎发育和胁迫响应等功能。研究揭示了种子微生物组在福尼奥适应环境中的潜在作用，为通过微生物组工程提高作物抗逆性提供了新思路。
图 福尼奥遗传群体多样性
图 福尼奥中SNP的关联分析
参考文献 [1]Host genotype, soil composition, and geo-climatic factors shape the fonio seed microbiome. Microbiome .2024. 产品介绍 随着质谱分析等平台的完善和基因组测序技术的发展，代谢组与基因组学相结合，形成以代谢组为基础的全基因组关联分析（MetaboliteGenome-Wide Association Study，mGWAS），该技术通过整合重测序和代谢组学数据来揭示基因变异与代谢物水平之间的关联，与传统表型 GWAS 相比，代谢产物数量庞大，遗传效应高，而且代谢物的种类、含量在不同品种或个体中具有极大差异，因而mGWAS有利于批量定位调控代谢物的候选基因，挖掘调控表型的相关代谢通路，深入了解植物代谢物合成调控的遗传机制。 分析流程
技术优势 1.多组学技术经验丰富：GWAS与代谢组项目经验丰富，分析团队与分析流程专业，为您的项目准确并且快速交付保驾护航。 2.数据库与科研支持：可提供配套数据库构建服务，这有助于提升科研水准，助力高水平研究成果的发表。 3.个性化服务分析：核心技术负责人均10年以上从业经验，经验丰富创新性强，可提供个性化分析服务，可以为客户提供 1V1 的个性化分析定制服务。
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本研究对401份番茄群体材料的酚胺物质进行了检测，通过基于代谢物全基因组关联分析(GWAS)鉴定出番茄2号染色体上的生物合成基因簇 BGC2与酚酰胺和水杨酸（SA）的生物合成相关，其关键成分SlEPS1 具有双催化功能，能合成酚酰胺和SA，过表达SlEPS1可增强番茄对Pst DC3000的抗性，敲除则更易感病。在番茄驯化过程中，抗病等位基因SlEPS1HapB 受到负选择，导致现代品种中酚酰胺和SA水平降低、抗病性下降。此外，SlMYB78可直接调控BGC2 基因簇，增强酚酰胺和SA的生物合成，进而调节对Pst DC3000的抗性。该研究揭示了酚酰胺和SA生物合成的协同调控机制，为理解植物免疫相关代谢的复杂性提供了新视角。
图 酚胺BGC2基因簇的定位与鉴定
参考文献 [1]A SlMYB78 regulated bifunctional gene cluster for phenolamide and salicylic acid biosynthesis during tomato domestication, reducing disease resistance. Journal of integrative plant biology . 2025. |
