在微生物研究领域，菌种鉴定是揭示微生物特性、功能及其生态作用的关键基础。传统培养鉴定方法存在耗时长、通量低等局限，而基于16S rDNA的高通量测序技术为这一难题提供了突破性解决方案。

16S rDNA作为细菌核糖体小亚基的编码基因，因其兼具保守区和高变区的独特结构特征，被誉为细菌分类的"分子钟"。该基因全长约1.5kb，其序列变异模式可精确反映细菌的系统发育关系。相较于传统方法，基于PacBio单分子实时测序（SMRT）技术灵敏度超高，能区分近缘菌种；适用范围广；还能批量处理样本，提升效率、降低成本。可应用于：环境科学、临床医学、工业生产等研究，实现种/株水平的微生物鉴定，为复杂微生物组研究提供更可靠的数据支持。

1）高特异性：可区分近缘菌种，分辨率达种/株水平；

2）高灵敏度：直接分析菌株信息；

3）高通量：支持批量样本并行检测，显著提升研究效率；

4）广适用性：覆盖绝大多数细菌类群。

1.分离培养的纯菌，其核酸进行两轮PCR扩增（设计特异引物），获得对应PCR产物；

2.使用干冰或者冰袋运送。

图 物种组成Krona圈图