微生物多样性测序三代全长扩增子宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序宏基因组元素循环测序高宿主污染去除宏基因组项目HiC-Meta宏基因组三代全长宏基因组宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序互作转录组测序比较转录组测序Meta-Barcoding(eDNA)技术研究5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台UMI-RNA-seq技术染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学植物单细胞核转录组动物单细胞核转录组动物单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组10x单细胞转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表
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产品介绍

单细胞RNA-seq(scRNA-seq)已经成为探究复杂组织中细胞类型、分子变化和细胞功能的重要手段。然而,单细胞技术要求从新鲜组织中制备单细胞悬液,获得高质量和高活性的细胞,但大量冻存样本因为无法制备高质量细胞悬液,这限制了单细胞技术的广泛应用。而单细胞水平上的核转录组测序(snRNA-seq)可以解决冻存样本中或细胞直径大的单细胞研究问题。单细胞核转录组测序可以精准获得每个细胞的表达谱特征,揭示细胞异质性,发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能,对深入了解样本中细胞间的类型划分和相互作用意义深远,是研究细胞基因表达异质性、发育分化过程、机制研究、环境响应、医学及农业育种等的重要手段。

分析原理

单细胞核转录组测序系统的关键技术是利用上百万独特的Barcode标记不同的样品细胞核。首先,含有Barcode序列的Gel beads与样品和酶的混合物混合,然后与油表面活性剂结合形成GEMsGel Bead-In-Emulsions,意为包裹Gel beads,样品以及酶的混合物的油滴)。收集GEMs流到储液器,Gel beads溶解释放Barcode序列,开始对样本细胞核进行标记。将每个液滴中含有Barcode信息的产物混合,构建标准测序文库。

从细胞核样品提取到最终数据获得,样品检测、建库、测序等每一环节都会直接影响数据的数量和质量,从而影响后续信息分析的结果。为从源头保证测序数据准确可靠,凌恩生物承诺在项目所有生产环节都严格把关,从根源上确保高质量数据的产出。单细胞核转录组整体实验流程图如下:


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单细胞核转录组测序实验流程



技术流程


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技术优势

1、研究对象广,如冻存样本以及直径较大的细胞均可适用,样品保存和运输更便捷;

2、直接抽核,降低细胞类型偏好性,获取更全面的细胞类型,发现稀有细胞类型,挖掘新Marker基因;

3、避免酶消化导致应激基因表达,减少“转录偏好”;

4、核内基因更多保持了转录本的异构体和可变剪接信息;

5、与scRNA-seq在细胞分群上趋于一致,具有类似的基因检出率。


送样要求

1脑、心脏、肌肉等含有直径大于40μm细胞的组织类型。

2、送-80℃冷冻保存或过液氮的组织或细胞建议冻存时间不宜过长。

3组织或细胞送样量的要求:1g或以上大小为0.5cm3


分析示例


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