上海凌恩生物科技有限公司

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转录组

eDNA

细胞器

特色技术服务

Meta-Barcoding（eDNA）技术研究

开展全基因组关联（GWAS）及QTL定位分析，筛选关键农艺性状候选基因，并深入开展农作物功能SNP标记开发，SNP标记芯片研究及育种分析服务器开发，育种在线管家系用构建，打造一体化动植物品种选育、农业科研及大数据算法解决方案，提升育种效率，为农牧业科研及应用提供专业优势技术支持。

技术路线

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核心标记挖掘分析

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核心标记分析流程

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芯片设计流程

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图片9.jpg 凌恩生物种质资源数字化开发项目，基于液相捕获技术，芯片设计应用于育种研究句有以下优势：

应用广泛：

对任意物种的连续区域或特定SNP位点进行捕获测序。

信息量高：

一次可检出全基因组范围内的目标分子标记。

灵活性强：

标记位点数量可根据需要随时调整，无样本量要求。

精准度高：

高深度测序确保分型结果准确性，达99%以上。

性价比高：

只针对目标区域进行测序，降低了成本投入，提高数据效率。

定制化服务：

可根据客户需求，针对特定物种、特定区域进行探针定制及下游分析，可兼容多物种。

凌恩案例

案例1.全基因组测序显示了α硫丹对秀丽隐杆线虫的生殖细胞诱变性

期刊：Environmental Science &Technology

发表时间：2022年9月

影响因子：11.357

合作单位：中国科技大学

合作内容：样本组学数据收集+数据分析

本研究对3种基因型共179个秀丽隐杆线虫基因组采用全基因组测序技术，研究了α-硫丹在秀丽隐杆线虫中的生殖细胞诱变性。虽然低剂量的α-硫丹对小鼠的繁殖能力有轻微影响，1μM α-硫丹长期暴露显著增加了未暴露后代的突变频率。本研究揭示了α-硫丹对秀丽隐杆线虫生殖细胞的诱变作用及其可能机制。此外，研究结果表明，生殖细胞突变性可能是持久性有机污染物等环境化学品健康风险评估的必要考虑因素。

图1 WT N2蠕虫自发和α-硫丹诱导突变分析

图2 xpa-1和polη缺陷的线虫的突变谱和突变分布

参考文献：

Whole-Genome Sequencing Reveals Germ Cell Mutagenicity of α-Endosulfan in Caenorhabditis elegans. Environmental Science & Technology, 2022.

案例2：

合作单位：浙江省农业科学院

合作内容：样本组学数据收集 + 数据分析 + 数据管理平台构建 + 分析流程搭建

平台链接：http://www.gourdbase.cn/

项目简介：凌恩生物旗下VG生信团队（盈飞）助力浙江省农业科学院瓠瓜育种团队成功开发瓠瓜分子育种平台。该平台整合了相关的表型、标记、QTL、遗传图谱、品种等数据信息，构建起直观、友好的内联数据平台，可开展分子标记开发，QTL定位分析，遗传图谱绘制等多项育种相关生物信息数据处理功能，帮助育种研究人员更好的浏览、搜索和获取感兴趣的信息，加速育种优化及植物抗病类研究。

案例3：

合作单位：浙江省农业科学院黄鱼育种团队

合作内容：样本组学数据收集+ 数据分析 + 数据管理平台构建 + 分析流程搭建

平台链接：http://210.22.121.250:10666/

项目简介：凌恩生物旗下VG生信团队助力浙江省农业科学院黄鱼育种团队成功开发黄鱼分子育种平台。根据黄鱼育种特点、育种目标、育种专家需求进行个性化定制开发，整合表型和基因数据构建育种模型，通过育种模型进行育种值估算、排序，提升育种效率，辅助开展重测序分析、群体遗传学分析、全基因组选择育种、标记定位、搜索及查看育种相关得区间基因和功能。