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定制生信分析服务器,是凌波微课-生物信息实操课力荐的一款超高性价比生信分析服务器,有T140、T440、T640三种型号。

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心动不如行动!



产品详情优势


01 预装Linux操作系统、常用系统库文件、主流分析流程和工具,使用和学习门槛将大大降低。


操作系统

Ubuntu 16.04

内置4项分析流程;

傻瓜化操作、一键化得到分析结果、开机即用

微生物多样性分析流程

宏基因组分析流程

转录组分析流程

细菌基因组分析流程

内置常用生物信息学分析软件

Perl、Python、R、Java、BLAST、Primer3、imagemagick、ggplot2、Circos、IGV、seqkit、EMBOSS、MEGA、MEGAN6、BWA、samtools、Muscle、Lastz、Fastree、GeneWise

包管理器,轻松实现自动化安装和部署

deb应用程序管理器apt-get

开源生信软件管理系统和环境管理系统conda


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02 国际品牌服务器供应商,高性价比配置首选,更有不同配置选择,满足您的个性化需求~

戴尔DELL T440塔式服务器;2040线程;128G内存;32T存储

CPU

2 颗英特尔至强银牌4210R处理器2.4GHz10C/20T9.6GT/s13.75M 缓存,TurboHT (100W) DDR4-2400

内存:

4 32GB RDIMM2933MT/s,双列

RAID卡:

PERC H730P 适配器 RAID 控制器2GB缓存

硬盘:

2 240G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5英寸热插拔 AG 硬盘,3 DWPD2628 TBW

硬盘:

4 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘

电源:

双电源450W

外设:

键盘鼠标显示器

售后:

3年质保


  • 可选硬件配置1

戴尔DELL T140塔式服务器;816线程;64G内存;8T存储

CPU

1颗 英特尔至强E-2288G处理器 3.7GHz16M 缓存, 8C/16Tturbo (95W)

内存:

4 16GB RDIMM, 2933MT/s双列

硬盘:

1 240G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5英寸热插拔 AG 硬盘,3 DWPD2628 TBW

硬盘:

1 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘

电源:

单电源365W

外设:

键盘鼠标显示器

售后:

3年质保


  • 可选硬件配置2

戴尔DELL T640塔式服务器;4080线程;256G内存;48T存储

CPU

2 颗英特尔至强金牌5218R处理器 2.1GHz, 20C/40T, 10.4GT/s27.5 M 缓存Turbo, HT (125W) DDR4-2666

内存:

8 32GB RDIMM, 2933MT/s ,双列

RAID卡:

PERC H730P 适配器 RAID 控制器,2GB缓存

硬盘:

2 480G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5 英寸热插拔,AG 硬盘,3 DWPD2628 TBW

硬盘:

6 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘

电源:

双电源450W

外设:

键盘鼠标显示器

售后:

3年质保


03 内置一键化分析流程,从此告别繁琐的重复性劳动

  • 流程配置

流程

功能详情

微生物多样性分析流程

原始数据质控,PE数据拼接,样本OTU 聚类和丰度信息计算,OTU代表序列分类学注释,多样性指数,稀释性曲线,Shannon-Wiener 曲线,Rank-Abundance 曲线,Specaccum 物种累积曲线,OTU 分布Venn 图,PCA 分析,PCoA 分析,NMDS 分析,群落结构 Bar 图和Pie 图,样本聚类树与柱状图组合分析,群落 Heatmap 图,OTU Table 抽平,Plsda分析,DCARDACCA 分析,分类学系统组成树,Adonis 多因素方差分析,Metastat 物种丰度差异分析,LEfSE 分析,系统发生进化树构建,(un)Weighted UniFrac 分析,Krona 饼图,样本距离箱式图,样本距离heatmap 图,Cytoscape网络分析

宏基因组分析流程

质控和数据统计:数据质量控制,去除宿主污染,数据统计;组装与基因预测:组装,基因预测;非冗余基因集与基因丰度表构建:构建非冗余基因集,基因丰度计算;物种与功能注释:物种分类注释,eggNOG功能注释,KEGG功能注释;物种与功能组成分析:Venn图,柱状图,饼图,Heatmap图,Krona多级物种组成图;样本比较分析:样本间距离分析,PCAPCOA,多样本聚类树,NmdsAnosimAdonis;物种与功能差异分析:Anova方差分析,Wilcoxon秩和检验,Kruskal wallis秩和检验,Lefse差异分析;关联分析:RDA/CCA分析,相关性热图,Cytoscape网络分析

转录组分析流程

原始数据统计,PE 数据质量剪切,原始数据比对,表达量计算,新转录本预测,可变剪切分析,基因覆盖度分析,基因饱和度分析,差异表达分析,差异基因维恩图,差异基因热图, PCA分析,样品 hclust 聚类树图,差异基因 GO 注释,GO 富集分析, GO 富集柱状图,差异基因 KEGG注释, KEGG 富集分析, KEGG 富集散点图

细菌基因组分析流程

原始数据质控,细菌基因组组装,组装结果评估,rRNA/tRNA查找,基因预测,基因注释,NR注释,GO注释,KEGG注释,COG注释,Swiss注释,CAZy碳水化合物相关酶注释,ARDB抗性/耐药注释,PHI病原与宿主互作数据库注释,毒力因子VFDB 注释,CRIPSR分析;

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