高端定制生信分析服务器，是凌波微课-生物信息实操课力荐的一款超高性价比生信分析服务器，有T140、T440、T640三种型号。
心动不如行动！
产品详情优势
01 预装Linux操作系统、常用系统库文件、主流分析流程和工具，使用和学习门槛将大大降低。
操作系统 | Ubuntu 16.04 |
内置4项分析流程； 傻瓜化操作、一键化得到分析结果、开机即用 | 微生物多样性分析流程 |
宏基因组分析流程 | |
转录组分析流程 | |
细菌基因组分析流程 | |
| 内置常用生物信息学分析软件 | Perl、Python、R、Java、BLAST、Primer3、imagemagick、ggplot2、Circos、IGV、seqkit、EMBOSS、MEGA、MEGAN6、BWA、samtools、Muscle、Lastz、Fastree、GeneWise等 |
| 包管理器，轻松实现自动化安装和部署 | deb应用程序管理器apt-get 开源生信软件管理系统和环境管理系统conda |
02 国际大牌服务器供应商，高性价比配置首选，更有不同配置选择，满足您的个性化需求~
戴尔DELL T440塔式服务器；20核40线程；128G内存；32T存储 | |
CPU： | 2 颗英特尔至强银牌4210R处理器2.4GHz，10C/20T，9.6GT/s，13.75M 缓存，Turbo，HT (100W) DDR4-2400 |
内存： | 4 条 32GB RDIMM，2933MT/s，双列 |
RAID卡： | PERC H730P 适配器 RAID 控制器，2GB缓存 |
硬盘： | 2 块 240G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5英寸热插拔 AG 硬盘，3 DWPD，2628 TBW |
硬盘： | 4 块 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘 |
电源： | 双电源450W |
外设： | 键盘鼠标显示器 |
售后： | 3年质保 |
可选硬件配置1
戴尔DELL T140塔式服务器；8核16线程；64G内存；8T存储 | |
CPU： | 1颗 英特尔至强E-2288G处理器 3.7GHz，16M 缓存， 8C/16T，turbo (95W) |
内存： | 4 条 16GB RDIMM, 2933MT/s，双列 |
硬盘： | 1 块 240G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5英寸热插拔 AG 硬盘，3 DWPD，2628 TBW |
硬盘： | 1 块 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘 |
电源： | 单电源365W |
外设： | 键盘鼠标显示器 |
售后： | 3年质保 |
可选硬件配置2
戴尔DELL T640塔式服务器；40核80线程；256G内存；48T存储 | |
CPU： | 2 颗英特尔至强金牌5218R处理器 2.1GHz, 20C/40T, 10.4GT/s，27.5 M 缓存，Turbo, HT (125W) DDR4-2666 |
内存： | 8 条 32GB RDIMM, 2933MT/s ，双列 |
RAID卡： | PERC H730P 适配器 RAID 控制器，2GB缓存 |
硬盘： | 2 块 480G SSD SATA 读取密集型 6Gbps 512 2.5 英寸热插拔，AG 硬盘，3 DWPD，2628 TBW |
硬盘： | 6 块 8TB 7.2K RPM SATA 6Gbps 512e 3.5英寸热插拔硬盘 |
电源： | 双电源450W |
外设： | 键盘鼠标显示器 |
售后： | 3年质保 |
03 内置一键化分析流程，从此告别繁琐的重复性劳动
流程配置
流程 | 功能详情 |
微生物多样性分析流程 | 原始数据质控，PE数据拼接，样本OTU 聚类和丰度信息计算，OTU代表序列分类学注释，多样性指数，稀释性曲线，Shannon-Wiener 曲线，Rank-Abundance 曲线，Specaccum 物种累积曲线，OTU 分布Venn 图，PCA 分析，PCoA 分析，NMDS 分析，群落结构 Bar 图和Pie 图，样本聚类树与柱状图组合分析，群落 Heatmap 图，OTU Table 抽平，Plsda分析，DCA、RDA、CCA 分析，分类学系统组成树，Adonis 多因素方差分析，Metastat 物种丰度差异分析，LEfSE 分析，系统发生进化树构建，(un)Weighted UniFrac 分析，Krona 饼图，样本距离箱式图，样本距离heatmap 图，Cytoscape网络分析 |
宏基因组分析流程 | 质控和数据统计：数据质量控制，去除宿主污染，数据统计；组装与基因预测：组装，基因预测；非冗余基因集与基因丰度表构建：构建非冗余基因集，基因丰度计算；物种与功能注释：物种分类注释，eggNOG功能注释，KEGG功能注释；物种与功能组成分析：Venn图，柱状图，饼图，Heatmap图，Krona多级物种组成图；样本比较分析：样本间距离分析，PCA，PCOA，多样本聚类树，Nmds，Anosim，Adonis；物种与功能差异分析：Anova方差分析，Wilcoxon秩和检验，Kruskal wallis秩和检验，Lefse差异分析；关联分析：RDA/CCA分析，相关性热图，Cytoscape网络分析 |
转录组分析流程 | 原始数据统计，PE 数据质量剪切，原始数据比对，表达量计算，新转录本预测，可变剪切分析，基因覆盖度分析，基因饱和度分析，差异表达分析，差异基因维恩图，差异基因热图， PCA分析，样品 hclust 聚类树图，差异基因 GO 注释，GO 富集分析， GO 富集柱状图，差异基因 KEGG注释， KEGG 富集分析， KEGG 富集散点图 |
细菌基因组分析流程 | 原始数据质控，细菌基因组组装，组装结果评估，rRNA/tRNA查找，基因预测，基因注释，NR注释，GO注释，KEGG注释，COG注释，Swiss注释，CAZy碳水化合物相关酶注释，ARDB抗性/耐药注释，PHI病原与宿主互作数据库注释，毒力因子VFDB 注释，CRIPSR分析； |
案例一
项目名称：慢性肝病风险计算软件（LiveBoost）
项目描述：项目构建了3个 梯度提升树模型(gradient boosting，GB) 旨在: 1）诊断慢性肝病; 2）区分肝纤维化和肝硬化; 3）区分早期和晚期肝纤维化。
服务单位：深圳市绘云生物科技有限公司专注于医学健康，开展精准医疗和大健康产业相关产品的研发，着力推动个体化医疗服务进展，是一家集科技服务、健康检测及产品研发为一体的高新科技企业。
案例二
项目名称：法医学分析系统（FISeq）
项目描述：法医领域STR、SNP快速分型、实现亲缘关系分析、实现CE数据比较，相关技术将应用于辅助拐卖、刑事等案件的侦破。
服务单位：深晓基因为法医系统提供一站式DNA检测产品和服务。希望通过NGS技术释放法医基因组学的真正潜力。深晓基因现已研发了一系列针对法医人类学的NGS试剂盒，此外，依据前期对东亚/中国人群的精细遗传结构的系统研究，深晓基因具有业内顶尖的NGS数据获取、处理和分析能力。深晓基因将致力成为法医遗传学领域的领航者。
案例三
项目名称：水稻全基因组SNP标记分子育种云平台
项目描述：本系统旨在为育种家提供能够大批量处理海量SNP标记数据、操作简单快捷的分析工具，辅助育种家开展全基因组SNP标记辅助分子育种计划。
服务单位：广东省农业科学院水稻研究所新品种选育研究室团队，团队以水稻第一个矮化品种矮仔占衍生到优质稻黄华占的育种体系为基础，开展广适性优质超级稻育种应用与遗传基础研究。迄今育成优质稻新品种91个，128次通过国家或省级品种审定（引种许可），获得植物新品种保护权12项，育成的水稻新品种南方稻区累计推广面积已达3亿亩以上。发表论文175篇。
款式1a：BiomicroClass凌波微课 JH1系列高端机架式服务器
报价：268,999（27万）
配置：128核心256线程；1T内存；384TB存储；
特点：适用于宏基因组、单细胞、大型动植物基因组分析，性能强劲，算力高，内存大，硬盘多。4U机架式服务器，需要独立的房间或机房存放服务器机柜。大课题组或2，3个课题组共用的最佳选择，既能满足日常常规的生信分析需要，也能满足极端资源需求的大数据生信分析。
总结：日均完成100+宏基因组样本分析，可存放约4万个宏基因组样本数据（10G/样本）。以人肠道为例，目前NCBI公共数据库的全球人肠道粪便宏基因组样本数量约3万不到。
编号 | 描述 | 数量 |
处理器 | AMD EPYC Milan 7713(2.0GHz/256M/64C/128T/225W) | 2 |
内存 | 64GB DDR4 RECC 3200MHz | 16 |
硬盘 | SSD 960GB SATA 数据中心 2.5 读取密集型 | 2 |
硬盘 | HDD 16T SAS 企业级 3.5 7200 | 24 |
阵列卡 | SAS3108 12Gbps 2GB 9361-8I RAID0,1,5,6,10,50和60支持超级电容 | 1 |
网络I/O | 集成2个100/1000M自适应以太网口+1个远程管理口 | 1 |
电源 | 1200W（1+1）高效节能服务器冗余电源 | 1 |
售后 | 3年质保 | 1 |
配件 | 机柜、导轨、鼠标、键盘、显示器、PDU | 1 |
外观：
款式2a：BiomicroClass凌波微课 JH2系列中端机架式服务器
报价：158,999（16万）
配置：64核心128线程；512G内存；192TB存储；
特点：2U机架式服务器，需要独立的房间或机房存放服务器机柜。性价比高，可以满足转录组、宏基因组、重测序等常规生信分析需要，一般课题组的最佳选择。
总结：日均完成40+宏基因组样本分析，可存放约1.9万个宏基因组样本数据（10G/样本）。
编号 | 描述 | 数量 |
处理器 | AMD EPYC Rome 7542（2.9G/128M/32C/225W） | 2 |
内存 | 64GB DDR4 RECC 3200MHz | 8 |
硬盘 | SSD 960GB SATA 数据中心 2.5 读取密集型 | 2 |
硬盘 | HDD 16T SATA 企业级 3.5 7200 | 12 |
阵列卡 | SAS3108 12Gbps 2GB 支持RAID 0,1,5,6,10,50和60 支持超级电容 | 1 |
网络I/O | 集成2个100/1000M自适应以太网口+1个远程管理口 | 1 |
电源 | 800W（1+1）高效节能服务器冗余电源 | 1 |
售后 | 3年质保 | 1 |
配件 | 机柜、导轨、鼠标、键盘、显示器、PDU | 1 |
外观：
款式1b：BiomicroClass凌波微课 TH1系列高端塔式服务器
报价：228,999（23万）
配置：128核心256线程；1T内存；128TB存储；
特点：适用于宏基因组、单细胞、大型动植物基因组分析，性能强劲，算力高，内存大。塔式服务器，噪音低，可放在办公室等人员密集场所，无需准备专门的房间。存储空间略显逊色，硬盘空间使用上需更精细的管理。
总结：日均完成80+宏基因组样本分析，可存放约1.2万个宏基因组样本数据（10G/样本）。
编号 | 描述 | 数量 |
处理器 | AMD EPYC Rome 7702（2.0G/256M/64C/128T/200W） | 2 |
内存 | 64GB DDR4 RECC 3200MHz | 16 |
硬盘 | SSD 960GB SATA 数据中心 2.5 读取密集型 | 2 |
硬盘 | HDD 16T SAS 企业级 3.5 7200 | 8 |
阵列卡 | SAS3108 12Gbps 2GB 支持RAID 0,1,5,6,10,50和60 支持超级电容 | 1 |
阵列卡 | SAS HBA卡 SAS3008-8R 12Gbps 支持RAID0,1,1E和10 | 1 |
网络I/O | 集成2个100/1000M自适应以太网口+1个远程管理口 | 1 |
电源 | 1250W高效节能服务器专用电源 | 1 |
售后 | 3年质保 | 1 |
配件 | 鼠标、键盘、显示器 | 1 |
外观：
款式2b：BiomicroClass凌波微课 TH2系列中端塔式服务器
报价：148,999（15万）
配置：64核心128线程；512G内存；128TB存储；
特点：性价比高，可以满足转录组、宏基因组、重测序等常规生信分析需要，一般课题组的最佳选择。塔式服务器，噪音低，可放在办公室等人员密集场所，无需准备专门的房间。
总结：日均完成40+宏基因组样本分析，可存放约1.2万个宏基因组样本数据（10G/样本）。
编号 | 描述 | 数量 |
处理器 | AMD EPYC Rome 7542（2.9G/128M/32C/225W） | 2 |
内存 | 64GB DDR4 RECC 3200MHz | 8 |
硬盘 | SSD 960GB SATA 数据中心 2.5 读取密集型 | 2 |
硬盘 | HDD 16T SATA 企业级 3.5 7200 | 8 |
阵列卡 | SAS3108 12Gbps 2GB 支持RAID 0,1,5,6,10,50和60 支持超级电容 | 1 |
阵列卡 | SAS HBA卡 SAS3008-8R 12Gbps 支持RAID0,1,1E和10 | 1 |
网络I/O | 集成2个100/1000M自适应以太网口+1个远程管理口 | 1 |
电源 | 1250W高效节能服务器专用电源 | 1 |
售后 | 3年质保 | 1 |
配件 | 鼠标、键盘、显示器 | 1 |
外观：
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选配：
凌恩生物同款的生物信息学组学分析流程，命令行批量处理样本，一键化分析流程，自动化出报告。多年行业经验（10年+），数据分析结果自动对接凌波微课-微客云平台，自动化改图生成文章发表图片。
案例一
项目名称：人血液外泌体中RNA的数据库（ exoRBase ）
链接地址：http://www.exorbase.org/
项目描述：可以帮助科研人员迅速获取来自人血液外泌体的RNA-seq数据分析得到的circRNA，lincRNA以及mRNA的信息
服务单位：上海市肿瘤研究所，成立于1958年，隶属于上海市教委。1980年被确认为世界卫生组织癌症预防与控制合作中心。1985年被批准建立癌基因及相关基因国家重点实验室。1996年与上海市科委共建基因治疗研究中试上海基地。2003年与上海交通大学共建上海交通大学肿瘤研究所。2010年，与仁济医院实现院所合一。
案例二
项目名称：旱獭数据库（ iMarmot ）
链接地址：http://www.marmotdb.org/
项目描述：旱獭相关的基因组序列、基因功能、基因表达量、同源基因、共线性区间、SNP突变、等信息的浏览、查询、搜索、比对功能。
服务单位：西安交通大学医学实验动物中心，是由西安交通大学医学院和陕西省卫生厅共同领导的科学研究机构，主要从事人类心血管病实验研究、实验动物教学、实验动物生产和销售、动物实验服务。
案例三
项目名称：瓠瓜数据库（ GourdBase）
链接地址：http://www.gourdbase.cn/
项目描述：GourdBase以基因组数据为中心，整合了相关的表型、标记、QTL、遗传图谱、品种等数据信息。是直观的、用户友好的、内联的数据平台，能够帮助研究人员和育种家更好地浏览、搜索和获取感兴趣的信息，加速研究。
服务单位：浙江省农业科学院蔬菜研究所，主要开展蔬菜瓜果新品种选育、栽培技术研究和新品种新技术示范推广工作。经过10多年的发展，已成为浙江省最大的集育、引、繁、推于一体的公益性蔬菜专业研究机构。
案例一
项目名称：NCU生物信息学分析平台
项目描述：实现果蔬发酵相关的多组学分析功能，包括微生物多样性分析、转录组分析、宏基因组分析、蛋白组分析、代谢组分析等
服务单位：南昌大学食品学院
案例二
项目名称：细菌基因组分析平台
项目描述：致病性病原微生物数据分析平台，主要内容涵盖相关的基因组和蛋白组数据分析。
服务单位：复旦大学BSL-3实验室
案例三
项目名称：代谢组一键化分析系统（ iIP4M ）
项目描述：实现代谢组数据的自动化分析流程，自适应算法生成分析结果图片，一键化生成报告。
服务单位：麦特绘谱生物科技(上海)有限公司(Metabo-Profile)，专注于精准医学和健康领域的代谢组学技术服务，致力于成为全球代谢组学研究者的首选合作伙伴。
cBioportal网站背景介绍
目前，癌症基因组学数据集的交互式探索平台飞速发展，cBioportal作为目前最流行的综合性数据库，在癌症临床和科研工作中被广泛应用，受到了极大的认可。目前，引用率已经达到5000多次。
cBioportal网站优势介绍
作为一个综合性的肿瘤数据库，cBioPortal整合了绝大部分的公共数据库资源。不仅如此，通过OncoPrinter、MutationMapper、可视化图表和组件，cBioPortal显著降低了复杂基因组数据与癌症研究人员之间的获取障碍，促进快速、直观、高质量地获取大规模癌症基因组学项目的分子谱和临床预后相关性，并使研究人员能够将这些丰富的数据集转化为生物学见解和临床应用。
cBioportal网站本地化服务介绍
在肿瘤分子检测应用越来越广泛的今天，开发团队希望能够将cBioportal网站与医院本地检测数据进行整合，从而将cBioportal的解读、查询、统计、可视化等优质功能无缝应用于本地分子检测结果。通过定制化构建本地化的数据库平台，整合本地数据和cBioportal公共数据，从而更好的服务于临床检测和临床科研。
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