微生物多样性测序三代全长扩增子5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in宏基因组测序三代宏基因组宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因分析宏基因组元素循环分析高宿主污染去除宏基因组项目宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序高通量16S rDNA菌种鉴定三代DNA宏病毒组MIG-seq肠道宏基因组绝对定量多营养级扩增子扩增子双因素分析动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱eQTL简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序mGWASMeta-Barcoding(eDNA)技术研究种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序定制生信分析服务器数据库开发构建服务高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学植物单细胞核转录组动物单细胞核转录组动物单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表
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产品介绍

元素循环是生物地球化学循环的重要环节,主要涉及碳、氮、磷、硫等元素的循环过程环境中的各种微生物会广泛参与到元素循环的过程中,其数量、质量及代谢速率与所在生态系统乃至整个生物圈的结构、功能、动态过程和生产密切相关。自然界中广泛分布的微生物是自然界碳、氮、磷、硫元素循环的主要驱动力,通过检测微生物基因组中涉及碳、氮、磷、硫代谢循环相关的功能基因,可综合分析不同生境下碳、氮、磷、硫循环的整体水平并评价微生物对此过程的影响,为环境健康和影响评价提供基因水平上的有力证据。

凌恩生物建立了完整的碳、氮、磷、硫循环循环模式图对宏基因组数据进行深入挖掘,通过循环模式图,确定不同代谢过程所涉及的功能基因及其丰度计算方法,对环境样品微生物群落碳、氮、磷、硫循环能力进行分析及比较,进一步通过对识别到的相关功能基因所属物种进行分类学注释,识别环境样本中参与碳、氮、磷、硫循环的主要功能微生物种属。


分析流程

宏基因组元素循环.png

   (以碳循环为例)   



送样要求


样本类型

要求

DNA样本

浓度30ng/ul,总量10ug

土壤、沉积物样本

2g

水体样本

≥5L,过0.22μm的滤膜,送滤膜

空气样本

使用空气抽滤机,使空气通过0.22 μm滤膜,膜上有可见覆盖物。

上述原始样本,需-80保存,干冰运输。

更多样本类型,欢迎详询凌恩生物技术支持



分析示例

整合.png

元素循环图



案例展示

元素循环ABUIABAEGAAgqvHNkwYoz5mMqQYw0gs45gI.png

期刊:Sci Total Environ    影响因子:7.963    发表时间:2022年3月

在污水处理和资源再利用领域,使用紫色光和细菌(PNSB)进行的生物处理过程受到了越来越多的关注,PNSB不仅仅是污水处理和资源利用的有效工具,其还是一个理想的微生物生态系统模型。本研究通过宏基因组测序结合binning的方法分析微生物群落的代谢功能。发现在不同光照条件下,PNSB中的CNP转化,并绘制出PNSB群落的CNP代谢网络。

图片7.png

PNSB群落的CNP代谢网络


参考文献


发表时间文章标题杂志名影响因子合作单位
2024Methylomonadaceae was the active and dominant methanotroph in Tibet lake sedimentsISME11.217南京农业大学
2024Methylomonadaceae was the active and dominant methanotroph in Tibet lake sedimentsMicroorganisms4.5南京农业大学&无锡水产学院



客户文章列表


发表时间

文章标题

杂志名

影响因子

合作单位

2024

Purines enrich root-associated Pseudomonas and improve wild soybean growth under salt stress

Nature Communications

16.6

中国农业科学院

2024

Toward nitrogen recovery: Co-cultivation of microalgae and bacteria enhances the production of high-value nitrogen-rich cyanophycin

Water Research

11.4

湘潭大学

2024

Phytoplankton-derived polysaccharides and microbial peptidoglycans are key nutrients for deep-sea microbes in the Mariana Trench

Microbiome

13.8

山东大学

2024

Sustainable lipids production in algal-bacterial consortia under low light intensity: Regulation of light–dark on fatty acid composition

Chemical Engineering Journal

13.4

湘潭大学

2024

Nanoscale zero-valent iron alleviated horizontal transfer of antibiotic resistance genes in soil: The important role of extracellular polymeric substances

Journal of Hazardous Materials

12.2

广东省微生物研究所

2024

Antibiotic resistomes and ecological risk elimination in field-scale constructed wetland revealed by integrated metagenomics and metatranscriptomics

Journal of Hazardous Materials

12.2

山东大学

2024

Deciphering Microbe-Mediated Dissolved Organic Matter Reactome in Wastewater Treatment Plants Using Directed Paired Mass Distance

Environmental Science & Technology

11.4

重庆大学

2024

New insights into the enteric methane production based on the archaeal genome map of ruminant gastrointestinal tract

Journal of Advanced Research

11.4

浙江大学畜牧业学院

2025

A novel decomposer-exploiter interaction framework of plant residue microbial decomposition

Genome Biology

10.1

南京农业大学

2022

Reduction of Redox Potential Exerts a Key Role in Modulating Gut Microbial Taxa and Function by Dietary Supplementation of Pectin in a Pig Model

Microbiology Spectrum

9.043

南京农业大学

2023

Analysis on driving factors of microbial community succession in Jiuyao of Shaoxing Huangjiu (Chinese yellow rice wine)

Food Research International

8.1

浙江树人学院