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元素循环是生物地球化学循环的重要环节,主要涉及碳、氮、磷、硫等元素的循环过程。环境中的各种微生物会广泛参与到元素循环的过程中,其数量、质量及代谢速率与所在生态系统乃至整个生物圈的结构、功能、动态过程和生产密切相关。自然界中广泛分布的微生物是自然界碳、氮、磷、硫元素循环的主要驱动力,通过检测微生物基因组中涉及碳、氮、磷、硫代谢循环相关的功能基因,可综合分析不同生境下碳、氮、磷、硫循环的整体水平并评价微生物对此过程的影响,为环境健康和影响评价提供基因水平上的有力证据。 凌恩生物建立了完整的碳、氮、磷、硫循环循环模式图,对宏基因组数据进行深入挖掘,通过循环模式图,确定不同代谢过程所涉及的功能基因及其丰度计算方法,对环境样品微生物群落碳、氮、磷、硫循环能力进行分析及比较,进一步通过对识别到的相关功能基因所属物种进行分类学注释,识别环境样本中参与碳、氮、磷、硫循环的主要功能微生物种属。
(以碳循环为例)
元素循环图
期刊:Sci Total Environ 影响因子:7.963 发表时间:2022年3月 在污水处理和资源再利用领域,使用紫色光和细菌(PNSB)进行的生物处理过程受到了越来越多的关注,PNSB不仅仅是污水处理和资源利用的有效工具,其还是一个理想的微生物生态系统模型。本研究通过宏基因组测序结合binning的方法分析微生物群落的代谢功能。发现在不同光照条件下,PNSB中的C、N、P转化,并绘制出PNSB群落的C、N、P代谢网络。
图 PNSB群落的C、N、P代谢网络
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