元素循环是生物地球化学循环的重要环节，主要涉及碳、氮、磷、硫等元素的循环过程。环境中的各种微生物会广泛参与到元素循环的过程中，其数量、质量及代谢速率与所在生态系统乃至整个生物圈的结构、功能、动态过程和生产密切相关。自然界中广泛分布的微生物是自然界碳、氮、磷、硫元素循环的主要驱动力，通过检测微生物基因组中涉及碳、氮、磷、硫代谢循环相关的功能基因，可综合分析不同生境下碳、氮、磷、硫循环的整体水平并评价微生物对此过程的影响，为环境健康和影响评价提供基因水平上的有力证据。
凌恩生物建立了完整的碳、氮、磷、硫循环循环模式图，对宏基因组数据进行深入挖掘，通过循环模式图，确定不同代谢过程所涉及的功能基因及其丰度计算方法，对环境样品微生物群落碳、氮、磷、硫循环能力进行分析及比较，进一步通过对识别到的相关功能基因所属物种进行分类学注释，识别环境样本中参与碳、氮、磷、硫循环的主要功能微生物种属。
（以碳循环为例）
样本类型 | 要求 |
DNA样本 | 浓度30ng/ul，总量≥10ug |
土壤、沉积物样本 | ≥2g |
水体样本 | ≥5L，过0.22μm的滤膜，送滤膜 |
空气样本 | 使用空气抽滤机，使空气通过0.22 μm滤膜，膜上有可见覆盖物。 |
上述原始样本，需-80℃保存，干冰运输。 |
更多样本类型，欢迎详询凌恩生物技术支持 |
元素循环图
期刊：Sci Total Environ 影响因子：7.963 发表时间：2022年3月
在污水处理和资源再利用领域，使用紫色光和细菌（PNSB）进行的生物处理过程受到了越来越多的关注，PNSB不仅仅是污水处理和资源利用的有效工具，其还是一个理想的微生物生态系统模型。本研究通过宏基因组测序结合binning的方法分析微生物群落的代谢功能。发现在不同光照条件下，PNSB中的C、N、P转化，并绘制出PNSB群落的C、N、P代谢网络。
图 PNSB群落的C、N、P代谢网络
| 发表时间 | 文章标题 | 杂志名 | 影响因子 | 合作单位 |
| 2024 | Methylomonadaceae was the active and dominant methanotroph in Tibet lake sediments | ISME | 11.217 | 南京农业大学 |
| 2024 | Methylomonadaceae was the active and dominant methanotroph in Tibet lake sediments | Microorganisms | 4.5 | 南京农业大学&无锡水产学院 |
发表时间 | 文章标题 | 杂志名 | 影响因子 | 合作单位 |
2024 | Purines enrich root-associated Pseudomonas and improve wild soybean growth under salt stress | Nature Communications | 16.6 | 中国农业科学院 |
2024 | Toward nitrogen recovery: Co-cultivation of microalgae and bacteria enhances the production of high-value nitrogen-rich cyanophycin | Water Research | 11.4 | 湘潭大学 |
2024 | Phytoplankton-derived polysaccharides and microbial peptidoglycans are key nutrients for deep-sea microbes in the Mariana Trench | Microbiome | 13.8 | 山东大学 |
2024 | Sustainable lipids production in algal-bacterial consortia under low light intensity: Regulation of light–dark on fatty acid composition | Chemical Engineering Journal | 13.4 | 湘潭大学 |
2024 | Nanoscale zero-valent iron alleviated horizontal transfer of antibiotic resistance genes in soil: The important role of extracellular polymeric substances | Journal of Hazardous Materials | 12.2 | 广东省微生物研究所 |
2024 | Antibiotic resistomes and ecological risk elimination in field-scale constructed wetland revealed by integrated metagenomics and metatranscriptomics | Journal of Hazardous Materials | 12.2 | 山东大学 |
2024 | Deciphering Microbe-Mediated Dissolved Organic Matter Reactome in Wastewater Treatment Plants Using Directed Paired Mass Distance | Environmental Science & Technology | 11.4 | 重庆大学 |
2024 | New insights into the enteric methane production based on the archaeal genome map of ruminant gastrointestinal tract | Journal of Advanced Research | 11.4 | 浙江大学畜牧业学院 |
2025 | A novel decomposer-exploiter interaction framework of plant residue microbial decomposition | Genome Biology | 10.1 | 南京农业大学 |
2022 | Reduction of Redox Potential Exerts a Key Role in Modulating Gut Microbial Taxa and Function by Dietary Supplementation of Pectin in a Pig Model | Microbiology Spectrum | 9.043 | 南京农业大学 |
2023 | Analysis on driving factors of microbial community succession in Jiuyao of Shaoxing Huangjiu (Chinese yellow rice wine) | Food Research International | 8.1 | 浙江树人学院 |
