凌恩生物
Biozeron

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数据库开发服务案例

案例一

项目名称:人血液外泌体中RNA的数据库exoRBase

链接地址: http://www.exorbase.org/

项目描述:可以帮助科研人员迅速获取来自人血液外泌体的RNA-seq数据分析得到的circRNAlincRNA以及mRNA的信息

服务单位:上海市肿瘤研究所,成立于1958年,隶属于上海市教委。1980年被确认为世界卫生组织癌症预防与控制合作中心。1985年被批准建立癌基因及相关基因国家重点实验室。1996年与上海市科委共建基因治疗研究中试上海基地。2003年与上海交通大学共建上海交通大学肿瘤研究所。2010年,与仁济医院实现院所合一。

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案例二

项目名称:旱獭数据库iMarmot

链接地址: http://www.marmotdb.org/

项目描述:旱獭相关的基因组序列、基因功能、基因表达量、同源基因、共线性区间、SNP突变、等信息的浏览、查询、搜索、比对功能。

服务单位:西安交通大学医学实验动物中心,是由西安交通大学医学院和陕西省卫生厅共同领导的科学研究机构,主要从事人类心血管病实验研究、实验动物教学、实验动物生产和销售、动物实验服务。

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案例三

项目名称:瓠瓜数据库GourdBase

链接地址: http://www.gourdbase.cn/

项目描述: GourdBase以基因组数据为中心,整合了相关的表型、标记、QTL、遗传图谱、品种等数据信息。是直观的、用户友好的、内联的数据平台,能够帮助研究人员和育种家更好地浏览、搜索和获取感兴趣的信息,加速研究。

服务单位:浙江省农业科学院蔬菜研究所,主要开展蔬菜瓜果新品种选育、栽培技术研究和新品种新技术示范推广工作。经过10多年的发展,已成为浙江省最大的集育、引、繁、推于一体的公益性蔬菜专业研究机构。

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科研成果应用系统开发服务案例

案例一

项目名称:慢性肝病风险计算软件LiveBoost

项目描述:项目构建了3个 梯度提升树模型(gradient boostingGB)  旨在: 1)诊断慢性肝病; 2)区分肝纤维化和肝硬化; 3)区分早期和晚期肝纤维化。

服务单位:深圳市绘云生物科技有限公司专注于医学健康,开展精准医疗和大健康产业相关产品的研发,着力推动个体化医疗服务进展,是一家集科技服务、健康检测及产品研发为一体的高新科技企业。

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案例二

项目名称:法医学分析系统FISeq

项目描述:法医领域STRSNP快速分型、实现亲缘关系分析、实现CE数据比较,相关技术将应用于辅助拐卖、刑事等案件的侦破。

服务单位:深晓基因为法医系统提供一站式DNA检测产品和服务。希望通过NGS技术释放法医基因组学的真正潜力。深晓基因现已研发了一系列针对法医人类学的NGS试剂盒,此外,依据前期对东亚/中国人群的精细遗传结构的系统研究,深晓基因具有业内顶尖的NGS数据获取、处理和分析能力。深晓基因将致力成为法医遗传学领域的领航者。

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案例三

项目名称:水稻全基因组SNP标记分子育种云平台

项目描述:本系统旨在为育种家提供能够大批量处理海量SNP标记数据、操作简单快捷的分析工具,辅助育种家开展全基因组SNP标记辅助分子育种计划。

服务单位:广东省农业科学院水稻研究所新品种选育研究室团队,团队以水稻第一个矮化品种矮仔占衍生到优质稻黄华占的育种体系为基础,开展广适性优质超级稻育种应用与遗传基础研究。迄今育成优质稻新品种91个,128次通过国家或省级品种审定(引种许可),获得植物新品种保护权12项,育成的水稻新品种南方稻区累计推广面积已达3亿亩以上。发表论文175篇。

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生信分析系统开发服务

案例一

项目名称:NCU生物信息学分析平台

项目描述: 实现果蔬发酵相关的多组学分析功能,包括微生物多样性分析、转录组分析、宏基因组分析、蛋白组分析、代谢组分析等

服务单位:南昌大学食品学院

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案例二

项目名称:细菌基因组分析平台

项目描述:致病性病原微生物数据分析平台,主要内容涵盖相关的基因组和蛋白组数据分析。

服务单位:复旦大学BSL-3实验室

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案例三

项目名称:代谢组一键化分析系统iIP4M

项目描述:实现代谢组数据的自动化分析流程,自适应算法生成分析结果图片,一键化生成报告。

服务单位:麦特绘谱生物科技(上海)有限公司(Metabo-Profile),专注于精准医学和健康领域的代谢组学技术服务,致力于成为全球代谢组学研究者的首选合作伙伴。

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cBioportal网站本地化整合服务


cBioportal网站背景介绍

目前,癌症基因组学数据集的交互式探索平台飞速发展,cBioportal作为目前最流行的综合性数据库,在癌症临床和科研工作中被广泛应用,受到了极大的认可。目前,引用率已经达到5000多次。

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cBioportal网站优势介绍

作为一个综合性的肿瘤数据库,cBioPortal整合了绝大部分的公共数据库资源。不仅如此,通过OncoPrinterMutationMapper、可视化图表和组件,cBioPortal显著降低了复杂基因组数据与癌症研究人员之间的获取障碍,促进快速、直观、高质量地获取大规模癌症基因组学项目的分子谱和临床预后相关性,并使研究人员能够将这些丰富的数据集转化为生物学见解和临床应用。

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cBioportal网站本地化服务介绍

在肿瘤分子检测应用越来越广泛的今天,开发团队希望能够将cBioportal网站与医院本地检测数据进行整合,从而将cBioportal的解读、查询、统计、可视化等优质功能无缝应用于本地分子检测结果。通过定制化构建本地化的数据库平台,整合本地数据和cBioportal公共数据,从而更好的服务于临床检测和临床科研。




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