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产品介绍

宏转录组测序(Metatranscriptome),是指从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况,以及转录调控规律的研究手段。相较于宏基因组,宏转录组可以从转录水平研究复杂微生物群落变化,更好的挖掘潜在的新基因。



技术流程

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技术优势

  • 基于高通量测序技术,高效低成本解决微生物组学活性功能研究。

  • 宏组学与代谢组等数据结合分析,多组学深入挖掘生物学意义;
  • 流程优化,项目周期显著降低;
  • 11项目服务,直接对接生信分析师,没有中间环节,沟通更高效。



送样要求

  • RNA总量:RNA总量2ug

  • RNA纯度:OD260/2801.8-2.0之间,核酸完整无降解




分析示例

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contig长度分布图



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单样本物种分布饼图



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多样本物种分布条形图



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单样本COG功能分类统计图


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Cazy分类统计



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抗生素抗性类型统计图



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物种构成heatmap图(以Phylum分类水平为例)


图片9.png差异基因可视化散点图及火山图



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上下调差异基因GO注释柱形图



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KEGG富集图



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差异KO代谢通路图


客户文章

1. Carboxylesterases from bacterial enrichment culture degrade strobilurin fungicides. Science of the Total Environment (IF=10.753),2022

2. Assessing the in vitro digestion of Sesbania gum, a galactomannan from S. cannabina, and subsequent impact on the fecal microbiota. Journal of Functional Foods(IF=4.451), 2021

3. Exposed to Sulfamethoxazole induced hepatic lipid metabolism disorder and intestinal microbiota changes on zebrafish (Danio rerio). Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol(IF=3.228), 2021

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