微生物多样性测序三代全长扩增子宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序宏基因组元素循环测序高宿主污染去除宏基因组项目HiC-Meta宏基因组三代全长宏基因组宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序互作转录组测序比较转录组测序Meta-Barcoding(eDNA)技术研究5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台UMI-RNA-seq技术染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学植物单细胞核转录组动物单细胞核转录组动物单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组10x单细胞转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表
021-31021022 ;13032137192

产品简介

宏基因组Binning的方法,可以在自然环境样本中有效区分每个菌株基因组信息。Binning即是从微生物群体序列中将不同个体的序列(readscontigs)分离开的过程。主要用于微生物组的两方面应用:关联分析和单菌组装。



分析流程

1681887860971.jpg



技术参数


实验策略

测序量

项目周期

400bp左右小片段文库

≧30G raw data

70个工作日



技术特色

  • 不依赖于微生物的分离培养,环境微生物单菌基因组(框架图)研究的一种新的途径和高性价比策略;

  • 可以得到环境中丰度较低的宏基因组,为研究低丰度微生物提供了途径;

  • 引入了宏观生态的研究理念,对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究,可以更准确地反应出微生物生存的真实状态;

  • 11项目服务,直接对接生信分析师,没有中间环节,沟通更高效;

  • 多组学关联分析,可关联代谢组等研究结果,全方面深化研究。


送样要求


样品类型

样品浓度样品总量

取样材料或者环境样本DNA

30ng/ul1ug



分析示例


宏基因组binning.png




部分凌恩客户文章


发表时间文章标题杂志名影响因子合作单位
2021An integrated gene catalog and over 10,000 metagenome-assembled genomes from the gastrointestinal microbiome of ruminantsMicrobime14.65南京农业大学
2024Toward nitrogen recovery Cocultivation of microalgae and bacteria enhances the production of high value nitrogen rich cyanophycinWater Research12.8湘潭大学
2023Iron oxides act as an alternative electron acceptor for aerobic methanotrophs in anoxic lake sedimentsWater Research12.8

中国科学院

南京地理与湖沼学研究所

2023From waste to resource: Metagenomics uncovers the molecular ecological resources for plastic degradation in estuaries of South ChinaWater Research12.8

辽宁省海洋与渔业

科学研究院

2024Distinct microbial hydrogen and reductant disposal pathways explain interbreed variations in ruminant methane yieldThe ISME Journal11.217

中国科学院

农业研究所

2024Soil redox status governs within-field spatial variation in microbial arsenic methylation and rice straighthead diseaseThe ISME Journal11南京农业大学
2023Methylotrophic methanogens and bacteria synergisticallydemethylate dimethylarsenate in paddy soil and alleviate ricestraighthead disease
The ISME Journal11南京农业大学
2024Tracking investigation of archaeal composition and methanogenesis function from parental to offspring pigs
Science of the Total Environment9.8浙江省农产品安全与营养研究所
2024From disinfection to pathogenicity: Occurrence, resistome risks and assembly mechanism of biocide and metal resistance genes in hospital wastewaters
Environ Pollut8.9

上海交通大学医学院附属瑞金医院感染控制科

2024Characterization and genetic determination of a newly isolated cotinine-degrading bacterium Terrabacter sp. strain cot-2 from synergistic consortium
Journal of Cleaner Production8.3南京农业大学
2023Straw-based compost cultivation disproportionally contributes to the environmental persistence of antibiotic resistance from raw cattle manure to organic vegetablesMicrobiological Research6.7南京农业大学