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产品简介

宏基因组Binning的方法,可以在自然环境样本中有效区分每个菌株基因组信息。Binning即是从微生物群体序列中将不同个体的序列(readscontigs)分离开的过程。主要用于微生物组的两方面应用:关联分析和单菌组装。



分析流程

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技术参数


实验策略

测序量

项目周期

400bp左右小片段文库

≧30G raw data

70个工作日



技术特色

  • 不依赖于微生物的分离培养,环境微生物单菌基因组(框架图)研究的一种新的途径和高性价比策略;

  • 可以得到环境中丰度较低的宏基因组,为研究低丰度微生物提供了途径;

  • 引入了宏观生态的研究理念,对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究,可以更准确地反应出微生物生存的真实状态;

  • 11项目服务,直接对接生信分析师,没有中间环节,沟通更高效;

  • 多组学关联分析,可关联代谢组等研究结果,全方面深化研究。


送样要求


样品类型

样品浓度样品总量

取样材料或者环境样本DNA

30ng/ul1ug



分析示例


宏基因组binning.png




部分凌恩客户文章


发表时间

文章标题

杂志名

影响因子

合作单位

2023

Iron oxides act as an alternative electron acceptor for aerobic methanotrophs in anoxic lake sediments

Water Research

13.4

中国科学院

2021

An integrated gene catalog and over 10,000 metagenome-assembled genomes from the gastrointestinal microbiome of   ruminants

Microbime

14.65

南京农业大学