染色体免疫共沉淀技术（ChIP, chromatin immunoprecipitation）是一种用于研究蛋白质与DNA的体内相互作用的经典实验技术。ChIP-seq采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀，由此可以把目的蛋白所结合的基因组DNA片段也富集下来。通过与高通量测序技术的结合，对ChIP后的DNA产物进行测序分析，从全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点，且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析，以高效率的测序手段得到高通量的数据结果。