凌恩生物
Biozeron

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产品介绍


转录组研究,存在有时间和空间上的特异性。不同空间位置和种类的细胞,以及每一个细胞在不同的生长阶段和环境下,其基因的表达都是有所差别的。单细胞转录组测序以单个细胞为单位,通过全基因组或转录组扩增,进行高通量测序。通过信息挖掘、研究可揭示单个细胞的基因表达状态,反应细胞间的表达异质性,在肿瘤研究、发育生物学、微生物学、神经科学等领域研究中发挥着重要作用。

10x Genomics单细胞转录组测序平台利用微流控、油滴包裹和barcode标记等技术来实现高通量的细胞捕获和标记,一次可以最多捕获8万个细胞,从而获得每个细胞的3'端的转录组信息;具备细胞通量高,建库成本低,捕获周期短的优势,该技术主要用于细胞分型和标记因子的鉴定,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,此外该技术还可以预测细胞分化与研究发育轨迹,在当下疾病,免疫,肿瘤领域以及组织,器官,发育研究中发挥越来越重要的作用。



分析原理

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技术流程

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技术优势


  • 不需要分选细胞,只需要制备细胞悬液,减少损伤
  • UMI技术引入,测序定量精准
  • 数高通量(8x10,000),周期短(一天完成建库)



送样要求


* 单细胞悬液(酶消化/流式分选);

* 培养基中不含有Ca2+&Mg2+等影响酶活的物质;

* 细胞直径40µm, 起始量≥105个,细胞活性≥90%为宜;

* 植物细胞需制备为原生质体悬液(公司不提供此项服务);

* 提供上门建库服务



分析示例


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数据表达量质控和标准化



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PCA降维分析QQ:表示细胞之间的相似性



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tSNE聚类图



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聚类间差异倍数最高top10的标记基因表达量热图



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标记基因在聚类中高表达分布图



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标记基因GO/KEGG富集图



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细胞分化轨迹分析



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细胞类型分析



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蛋白网络图分析



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WGCNA共表达网络分析