混池测序——即混合群体分离分析法(Bulked Segregant Analysis, BSA),是利用极端性状个体混池进行目标性状基因定位的一种快捷方法。在分离群体中,选取极端性状的子代DNA等量混合,对混合的“基因池”(GenePool)及亲本分别进行建库测序,计算不同文库的测序数据在多态位点(SNP)的频率(Allele Frequency,AF),与目标表型进行关联,从而实现目标性状相关的基因定位或者连锁分子标记的开发。
1.大型动植物基因组分析经验丰富,深入挖掘生物群体意义; |
2.流程优化,项目周期显著降低; |
3.结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本; |
4.提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。 |
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DNA总量≥500ng,浓度≥12ng/μl,无降解,无粘稠/颜色异常,无RNA/蛋白质污染; | 使用无DNase管,标记清晰,干冰寄送。 |
期刊:Bmc Genomics 影响因子:4.547 发表时间:2019年
油菜(Brassica napus L.)突变体增加了每株植物的角果数目,但其分子机制仍不清楚。本研究结合BSA和全基因组重新测序(WGR)技术,使用来自近等基因系(NILs)zws-ms和zws-217研究与油菜多角果性状相关的基因组区域。
研究结果
1、遗传分析获得了与油菜多角果性状相关的3个SNP和2个InDel。
2、基于功能注释的结果,筛选鉴定出与油菜多角果性状相关的基因组区域和候选基因。
发表时间
| 文章标题
| 杂志名
| 影响因子
| 合作单位
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2021
| Using Combined Methods of Genetic Mapping and Nanopore-Based Sequencing Technology to Analyze the Insertion Positions of G10evo -EPSPS and Cry1Ab/Cry2Aj Transgenes in Maize
| Frontiers in Plant Science
| 5.754 | 浙江省农业科学院
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2021
| BrLETM2 Protein Modulates Anthocyanin Accumulation by Promoting ROS Production in Turnip (Brassica rapa subsp. rapa)
| International Journal of Molecular Sciences | 4.556
| 东北林业大学
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2019
| Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus.
| BMC Genomics
| 3.594
| 四川农业科学院
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