混池测序——即混合群体分离分析法（Bulked Segregant Analysis, BSA），是利用极端性状个体混池进行目标性状基因定位的一种快捷方法。在分离群体中，选取极端性状的子代DNA等量混合，对混合的“基因池”（GenePool）及亲本分别进行建库测序，计算不同文库的测序数据在多态位点（SNP）的频率（Allele Frequency，AF），与目标表型进行关联，从而实现目标性状相关的基因定位或者连锁分子标记的开发。
1.大型动植物基因组分析经验丰富，深入挖掘生物群体意义； |
2.流程优化，项目周期显著降低； |
3.结合公共数据库样品信息联合分析，节省成本； |
4.提供基因组数据构建服务，让数据后期利用更加便利。 |
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DNA总量≥500ng，浓度≥12ng/μl，无降解，无粘稠/颜色异常，无RNA/蛋白质污染； | 使用无DNase管，标记清晰，干冰寄送。 |
期刊：Bmc Genomics 影响因子：4.547 发表时间：2019年
油菜（Brassica napus L.）突变体增加了每株植物的角果数目，但其分子机制仍不清楚。本研究结合BSA和全基因组重新测序（WGR）技术，使用来自近等基因系（NILs）zws-ms和zws-217研究与油菜多角果性状相关的基因组区域。
研究结果
1、遗传分析获得了与油菜多角果性状相关的3个SNP和2个InDel。
2、基于功能注释的结果，筛选鉴定出与油菜多角果性状相关的基因组区域和候选基因。
图snp-index分布(差值)
图ED分布
发表时间 | 文章标题 | 杂志名 | 影响因子 | 合作单位 |
2024 | A microRNA396b-growth regulating factor module controls castor seed size by mediating auxin synthesis | Plant Physiology | 6.5 | 东北林业大学 |
2021 | Using Combined Methods of Genetic Mapping and Nanopore-Based Sequencing Technology to Analyze the Insertion Positions of G10evo -EPSPS and Cry1Ab/Cry2Aj Transgenes in Maize | Front Plant Sci | 5.754 | 浙江省农业科学院 |
2024 | Characterization and fine mapping of cold-inducible parthenocarpy in cucumber (Cucumis sativus L.) | Plant Science | 5.2 | 南京农业大学 |
2021 | BrLETM2 Protein Modulates Anthocyanin Accumulation by Promoting ROS Production in Turnip (Brassica rapa subsp. rapa) | International Journal of Molecular Sciences | 4.556 | 东北林业大学 |
2024 | Identification of loci and candidate genes related to nodulation in soybean | Plants-Basel | 4 | 中国农业科学院 |
2019 | Identification of genomic regions associated with multi-silique trait in Brassica napus | BMC Genomics | 3.594 | 四川农业科学院 |
