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产品介绍 细菌基因组测序，可分为细菌基因组扫描、细菌基因组完成图和细菌基因组重测序。 细菌基因组扫描，即通过高通量测序技术，对已有参考基因组或无参的细菌样本进行测序，获得细菌基因组框架图的研究。并可基于细菌基因组框架图开展基因功能注释、比较基因组学及泛基因组研究。 细菌基因组完成图测序，即从头测序，是指不需要任何现有的序列信息就可以对某个细菌物种进行测序，利用生物信息学分析手段对序列进行拼装，从而获得该细菌物种的基因组序列。并可基于细菌基因组完成图开展基因功能注释、比较基因组学及泛基因组研究。 细菌基因组重测序，基于已知参考基因组的细菌物种进行高通量测序研究，一般重点关注基因组变异（SNP、InDel等）情况，亦可进行群体研究。可关注大量的单核苷酸多态性位点（SNP）、插入缺失（InDel, Insertion/Deletion）、结构变异（Structure Variation，SV）等变异信息。 细菌基因组测序可以预测重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制，已取代传统方法成为研究细菌进化遗传机制、关键功能基因的重要工具。
技术优势： 凌恩生物细菌基因组完成图项目，业内率先提出0N，0gap交付指标，并可实现多质粒细菌的质粒基因组研究、针对多质粒、异常GC含量及较大（genome size >=6Mb）的细菌基因组提供高水平交付，并可提供比较基因组学、泛基因组学等多层次深入研究个性化解决方案，是您细菌基因组研究的不二之选。
技术策略
技术流程
细菌基因组扫描项目分析流程
细菌基因组完成图项目分析流程
送样要求
分析示例
细菌基因组圈图 多质粒基因组圈图
病原-宿主互做注释
GI岛预测
比较基因组直系同源基因venn图
系统进化树构建
cgMLST菌株高精度分型及群体进化分析
比较基因组群体共线性分析
项目经验（部分客户文章） 1. A novel ATP dependent dimethylsulfoniopropionate lyase in bacteria that releases dimethyl sulfide and acryloyl-CoA.Elife(IF=8.146),2021 2. The Second Chromosome Promotes the Adaptation of the Genus Flammeovirga to Complex Environments.Microbiol Spectr(IF=7.171),2021 3. Increasing prevalence of hypervirulent ST5 methicillin susceptible Staphylococcus aureus subtype poses a serious clinical threat .Emerging Microbes & Infections (IF=7.163),2021 4. Genomic Investigation of Proteus mirabilis Isolates Recovered From Pig Farms in Zhejiang Province, China.Frontiers in Microbiology (IF=6.064),2022 5. Characterization of metabolite, genome and volatile organic compound changes provides insights into the spoilage and cold adaptive markers of Acinetobacter johnsonii XY27.LWT (IF=6.056),2022 6. Regulation of bla system in ST59-related oxacillin-susceptible mecA-positive Staphylococcus aureus.J Antimicrob Chemother(IF=5.79),2021 7. Tetracycline degradation by Klebsiella sp. strain TR5: Proposed degradation pathway and possible genes involved.Chemosphere(IF=5.778),2020
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