微生物多样性测序三代全长扩增子宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序宏基因组元素循环测序高宿主污染去除宏基因组项目HiC-Meta宏基因组三代全长宏基因组宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序互作转录组测序比较转录组测序Meta-Barcoding(eDNA)技术研究5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台UMI-RNA-seq技术染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学植物单细胞核转录组动物单细胞核转录组动物单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组10x单细胞转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表
021-31021022 ;13032137192

产品介绍


病毒(Virus)由一种核酸分子(DNARNA)与蛋白质(Protein)构成或仅由蛋白质构成(如 朊病毒)。根据遗传物质的组成,将所有已知的病毒分为DNA病毒——单链DNA病毒,DNA病毒——双链DNA病毒,DNARNA反转录病毒,RNA病毒——双链RNA病毒,RNA病毒——单链RNA病毒裸露RNA病毒及类病毒等八大类群。此外,还增设亚病毒因子一类。目前病毒约4000种,设有三个病毒目,64个病毒科,9个病毒亚科,233个病毒属,其中29个病毒属为独立病毒属。亚病毒因子类群,不设科和属。包括卫星病毒和prion(传染性蛋白质颗粒或朊病毒)。一些属性不很明确的属称暂定病毒属。

病毒根据宿主类型的不同,可以分为噬菌体(细菌病毒)、植物病毒(烟草花叶病毒)和动物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。

病毒基因组结构简单,一般只含有单一核酸,在探究病毒的毒力系统、病毒的基因组进化与演变历程方面意义深远,可以为揭示病毒流行病变化趋势等提供有力参考。

病毒全基因组测序,是指基于第二代高通量测序技术,对病毒全基因组进行测序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因组序列,解析编码信息,并获得相应的变异信息。



技术流程

                                          ABUIABAEGAAg-az0oQYowKvJQjDQBji2BQ!600x600.jpg



送样要求


01
02

分析病毒感染样本血清,-80保存干冰运输;

DNA/cDNA总量2ug浓度100ng/ul无降解无粘稠无颜色异常,无RNA/蛋白质污染

干冰寄送使用无DNase管存放标记清晰。



应用范围

  • 对全新的病毒进行测序,获得框架图/完整序列

  • 对基因组已知的病毒进行基因组重测序,进行多态性分析
  • 基因预测、功能注释和比较基因组学(SNPInDel. Pan-genome)分析
  • 多种基因预测软件确保基因预测的准确性


分析示例

病毒基因组.png



部分凌恩客户文章


发表时间

文章标题

杂志名

影响因子

合作单位

2023

Biological and Genomic Characteristics of MaMV-DH01, a Novel
Freshwater Myoviridae Cyanophage Strain

Microbiology Spectrum

9.043

河海大学

2024

Physiological and metabolic insights into the first cultured anaerobic representative of deep-sea Planctomycetes bacteria

eLife

8.713

中国科学院海洋研究所深海研究中心

2021

Isolation, characterization and comparison of lytic Epseptimavirus phages targeting Salmonella

Food Research International

6.475

大连理工大学

2022

Isolation and characterization of a novel phage vB_ValP_VA-RY-3 infecting Vibrio alginolyticus

Virus Research

6.286

大连理工大学

2022

RetS Regulates Phage Infection in Pseudomonas aeruginosa via Modulating the GacS/GacA Two-Component System

Journal of Virology

5.942

中国海洋大学

2021

A Novel Polyvalent Bacteriophage vB_EcoM_swi3 Infects Pathogenic Escherichia coli and Salmonella enteritidis

Front Microbiol

5.64

青岛农业大学

2020

The endolysin of the Acinetobacter baumannii phage vB_AbaP_D2 shows broad antibacterial activity

Microbial Biotechnology

5.328

大连理工大学

2022

Biological and genomic characteristics of two bacteriophages isolated from sewage, using one multidrug-resistant and one non-multidrug-resistant strain of   Klebsiella pneumoniae

Frontiers in Microbiology

5.2

中国农业大学

2020

A newly recorded Rickettsia of the Torix group is a recent intruder and an endosymbiont in the whitefly Bemisia tabaci

Environmental Microbiology

5.147

浙江大学

2022

Isolation and Characterization of a Novel Vibrio natriegens—Infecting Phage and Its Potential Therapeutic Application in Abalone Aquaculture

Biology

5.079

厦门大学

2021

Isolation and Identifification of Type F Bovine Enterovirus from Clinical Cattle with Diarrhoea

Viruses

5.048

南京农业大学

2022

Genetic and Pathogenic Characterization of a New Iridovirus Isolated from Cage-Cultured Large Yellow Croaker (Larimichthys crocea) in China

Viruses

5.048

浙江海洋大学,福建农林大学

2022

Genomic and phylogenetic analysis of the first myovirus isolated from Oceanospirillaceae, representing a novel viral cluster prevalent in polar oceans

Applied and Environmental Microbiology

5.005

中国海洋大学

2024

Isolation and characterization of a novel temperate bacteriophage infecting Aeromonas hydrophila isolated from a Macrobrachium rosenbergii larvae pond

Virus Res

5

浙江师范大学

2024

Vibrio cyclitrophicus phage encoding gene transfer agent fragment, representing a novel viral family

VIROLOGY

5

中国海洋大学