微生物多样性测序三代全长扩增子宏基因组测序宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因测序宏基因组元素循环测序高宿主污染去除宏基因组项目HiC-Meta宏基因组三代全长宏基因组宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序互作转录组测序比较转录组测序Meta-Barcoding(eDNA)技术研究5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台UMI-RNA-seq技术染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学植物单细胞核转录组动物单细胞核转录组动物单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组10x单细胞转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表
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产品介绍


发现和鉴定新病毒以及确定新病毒与疾病的关系是预防、诊断和治疗新发病毒性传染病的首要任务。高通量测序技术突破了传统技术方法的局限,可以直接以标本中所有的遗传物质为研究对象,从而能够快速地鉴定出标本中存在的病毒,形成了一门研究特定环境中病毒群落的新兴学科:病毒宏基因组学(宏病毒组)

传统意义上有很多用于发现新病毒的方法,如病毒分离、核酸检验、血清学试验等,但它们都有一定的局限性。但利用高通量测序发现新病毒具有信息量大、对标本所含信息无偏倚、操作较简单、检测成本较低等独特优点,使得该技术已成为目前病毒发现的重要技术之一,其在病毒诊断、溯源、预警等方面具有实用意义。

病毒宏基因组测序,又叫宏病毒组测序(Virome),是直接以环境样本中所有病毒的遗传物质为研究对象,进行病毒分析生物学检测的技术,能够快速准确的鉴定出环境中所有病毒的组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物预警研究等方面有重要作用。

2018年,全球病毒组计划 (The Global Virome Project) 启动,旨在鉴定出地球上大部分未知病毒。丰富病毒参考数据库如NCBIJGI,构建新的海洋病毒数据库(GOV)。病毒组序列鉴定分类,对于研究病毒与宿主功能互作意义重大!



技术流程


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分析策略


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应用范围


  • 直接或间接参与地球生物化学循环

  • 调控寄主群落结构

  • 病毒与寄主共进化推动地球生态系统的多样性



宏病毒样本类型及要求


样本类型

体积或质量

可检测核酸范围(纳克)

海水DNA病毒

100

20-200

人类粪便DNA病毒

500毫克

500-3000

人类粪便RNA病毒

500毫克

140-500

海洋沉积物DNA病毒

1

50-100

微生物DNA病毒

1

50-100

珊瑚组织DNA病毒

1

60-100



分析示例


环境宏病毒组测序.png


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发表时间文章标题杂志名影响因子合作单位
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2024The bacteriome-coupled phage communities continuously contract and shift to orchestrate the traditional rice vinegar fermentationFood Research International8.1浙江工商大学
2024The bacteriome-coupled phage communities continuously contract and
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2022Virioplankton assemblages from Challenger Deep, the deepest place in the oceansiScience7.396中国海洋大学
2022Diversity and potential functional characteristics of phage communities colonizing microplastic biofilmsEnvironmental Research6.498河海大学
2021Saline lakes on the Qinghai-Tibet Plateau harbor unique viral assemblages mediating microbial environmental adaptioniScience5.458中国海洋大学