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产品介绍


转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA。转录组测序能够从整体水平研究基因表达量以及基因结构,揭示特定生物学过程中的分子机理;目前已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等领域。

真核无参转录组测序,是针对没有参考基因组的真核生物特定组织或细胞在某一状态下转录出来的RNA进行建库测序。基于测序数据进行转录本组装,下游可开展功能注释、SNPSSR标记开发多个样本的差异基因表达分析和差异基因功能富集分析等,可用于发现新的功能基因,为基因的表达研究及相关分子机制研究提供技术支撑。



技术流程

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分析流程


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送样要求


  • RNA总量:≥2ug
  • RNA浓度:≥100 ng/ul
  • RIN值:≥7.0



技术特色


  • 可检测未知基因,发现新的转录本;
  • 丰富的项目经验全方位分析基因表达水平和结构信息;
  • 11项目服务,直接对接生信分析师,没有中间环节,沟通更高效
  • 多种个性化分析方案,全方位满足研究需要,助力科研成功。



分析示例


GO多级分类注释分布饼图


KEGG注释统计



差异基因可视化散点图及火山图



上下调差异基因GO注释柱形图



SSR的分布情况


差异基因共表达网络图


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差异KEGG的泰森多边形



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时序表达模式heatmap



项目经验(近期部分客户文章)

1. Brassicaceae transcriptomes reveal convergent evolution of super-accumulation of sinigrin .COMMUNICATIONS BIOLOGY (IF=6.268),2021

2. Enhanced Reactive Blue 4 Biodegradation Performance of Newly Isolated white rot fungus Antrodia P5 by the Synergistic Effect of Herbal Extraction Residue.Frontiers in Microbiology(IF=4.253),2021

3. Transcriptome and 16S rRNA analyses revealed differences in the responses of largemouth bass (Micropterus salmoides) to early Aeromonas hydrophila infection and immunization.Aquaculture(IF=3.224),2021

4. Transcriptomic analysis of juvenile Chinese sea bass (Lateolabrax maculatus) anesthetized by MS-222 (tricaine methanesulfonate) and eugenol. Fish Physiol Biochem.(IF=1.729), 2020.

5. Serum biochemistry, liver histology and transcriptome profiling of bighead carp Aristichthys nobilis following different dietary protein levels. Fish and Shellfish Immunology (IF=3.185), 2019.




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