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产品介绍 Hi-C源于染色体构象捕获(Chromosome Confromation Capture,3C)技术,是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质三维结构信息。 结合多种测序测序手段,Hi-C技术可在单样本内实现辅助基因组组装,排序及定向,使“染色体级别基因组组装”成为可能。在大型动植物基因组研究中,通常先利用二代测序及三代测序技术获取数据进行组装,再借助Hi-C技术,就可以将序列轻松挂载到染色体上。针对已有参考基因组的物种研究,在原有的基因组基础上,借助Hi-C技术可以大幅提升基因组质量。基因组研究领域,Hi-C技术俨然已成为研究者不可或缺的技术手段。 凌恩生物推出大型动植物基因组多种整合技术手段组装,通过Hi-C建库辅助组装,结合三代测序及多种长片段读取技术,使得大型动植物基因组染色体级别的组装不再困难,让您的基因组研究“更上一层楼”。 技术原理
技术流程
送样要求
技术特色
分析示例 示例一
期刊:Nature Communications 影响因子:16.6 发表时间:2023 黄籽性状是甘蓝型油菜的一种理想育种特性,可大大提高籽油产量和质量。然而,控制这一表型的潜在机制因其复杂性而难以确定。本研究通过全基因组测序和Hi-C辅助组装,得到了油菜的高质量基因组,通过联合其他组学,深入解析了油菜的表型遗传机制,为培育更高商业价值的油菜提供了新方法。
1. 研究组装出黑籽(ZY821)和黄籽(GH06)油菜的高质量基因组,并发现基因组组装长度的差异主要是由着丝粒和端粒重复序列组装的差异造成的。 2. 通过候选基因挖掘鉴定,发现BnA09MYB47a是种皮色素沉着的关键调控因子,是培育优质油菜的候选基因。 表油菜组装基因组的比较
示例二
本研究基于HIFI+HiC组装技术以及转录组、全基因组重测序数据和生理表型数据,首次系统分析了腹足类短滨螺(Littorina brevicula)的系统发育模式、热敏感性和遗传分化,为理解气候变化对生物分布的影响提供了更加全面的见解。
1.本研究组装了一个高质量的短滨螺基因组,为后续探究与温度适应相关的遗传变异打下了坚实的基础 2.建立了基于生理和遗传性状的机理性物种分布模型来预测不同遗传亚群在气候变化下的分布
图 短滨螺基因组组装 部分凌恩客户文章
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上海凌恩生物科技有限公司(简称“凌恩生物”)成立于2014年,是一家从事组学科研技术服务的高新技术企业。凌恩生物拥有完备的组学测序技术平台,业务板块涉及组学研究的多个领域方向。截至2024年,凌恩生物已成立分公司或分支机构6家,服务范围辐射全球。
以打造高品质测序及生物信息分析研发服务团队为目标,凌恩生物注重创新、时刻关注科研需求,先后研发了包括eDNA Metabarcoding,宏基因组元素循环分析,宏基因组抗性基因分析,高宿主污染去除宏基因组,宏转录组在内的微生态系列特色产品,备受广大科研工作者关注。凌恩技术团队参与的项目成果也多次发表在《Nature》《Cell》《PNAS》等国际高端学术期刊上。秉持专业务实,追求卓越的理念,凌恩生物将满怀信心、迎接挑战,坚持应用新技术,研发新产品,助力科研。