微生物多样性测序三代全长扩增子5R 16S rRNA微生物多样性绝对定量 Spike-in宏基因组测序三代宏基因组宏基因组Binning分析宏基因组抗性基因分析宏基因组元素循环分析高宿主污染去除宏基因组项目宏转录组差异表达测序环境宏病毒组测序医学宏病毒组测序高通量16S rDNA菌种鉴定三代DNA宏病毒组MIG-seq肠道宏基因组绝对定量多营养级扩增子扩增子双因素分析动植物基因组Denovo测序细菌基因组测序项目真菌基因组测序项目病毒基因组测序项目简化基因组遗传图谱eQTL简化基因组GWAS测序BSA混池测序基因组SSR开发基因组重测序三代重测序真核有参转录组测序真核无参转录组测序原核链特异性转录组测序全长转录组(有参_无参)测序LncRNA测序Small RNA测序mGWASMeta-Barcoding(eDNA)技术研究种质资源数字化解决方案转座子插入测序(Tn-seq)PlantArray植物生理组平台染色体级别基因组组装Hi-C建库叶绿体、线粒体基因组测序定制生信分析服务器数据库开发构建服务高通量土壤生物检测Astral蛋白质组学10×单细胞核转录组10×单细胞转录组华大Stereo-seq空间转录组测序DNBelab C-TaiM4单细胞核转录组DNBelab C-TaiM4单细胞转录组单菌株单细菌转录组人肠道单细菌转录组单细胞转录组(SMART)测序靶向代谢组分析非靶向代谢组分析ATAC-seqChip-seqRip-seq全基因组甲基化分析微课云交付平台扩增子引物列表资料下载送样指南客户文章列表

产品介绍


Hi-C源于染色体构象捕获Chromosome Confromation Capture,3C)技术以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质三维结构信息。

结合多种测序测序手段,Hi-C技术可在单样本内实现辅助基因组组装,排序及定向,使“染色体级别基因组组装”成为可能。在大型动植物基因组研究中,通常先利用二代测序及三代测序技术获取数据进行组装,再借助Hi-C技术就可以序列轻松挂载到染色体上针对已有参考基因组的物种研究,在原有的基因组基础上,借助Hi-C技术可以大幅提升基因组质量。基因组研究领域Hi-C技术俨然已成为研究者不可或缺的技术手段。

凌恩生物推出大型动植物基因组多种整合技术手段组装,通过Hi-C建库辅助组装,结合三代测序及多种长片段读取技术,使得大型动植物基因组染色体级别的组装不再困难,让您的基因组研究“更上一层楼”。


技术原理


染色体级别基因组组装Hi-C建库1.png

(1)通过甲醛交联固定,将细胞内由蛋白质介导的空间上邻近的染色质片段进行共价连接;

(2)限制性内切酶进行酶切;

(3)使用生物素标记末端标记;

(4)将连接的DNA纯化后超声打断,并用生物素亲和层析,将生物素化的DNA片段分离,加上接头进行高通量测序。


技术流程


送样要求


组织

2-3g

核酸

15μg


技术特色


1、无需专门构建群体,单个样本实现辅助基因组组装、排序及定向;

2、精确率高,周期短,快速提升科研水平;

3、凌恩生物整合多种技术手段:可提供包括PacbioBionanoHi-CIllumina10X GenomicsChicagoNRGene在内的多种组装策略和研究方案

4、专业的基因组研究团队,核心技术负责人均10年以上领域研究经验;

5、完整的基因组学分析管理工具提供商,包括泛基因组分析、单倍型数据库构建、分子育种等等

6、提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利


分析示例

示例一

图片10.png

期刊:Nature Communications         影响因子:16.6        发表时间:2023

黄籽性状是甘蓝型油菜的一种理想育种特性,可大大提高籽油产量和质量。然而,控制这一表型的潜在机制因其复杂性而难以确定。本研究通过全基因组测序和Hi-C辅助组装,得到了油菜的高质量基因组,通过联合其他组学,深入解析了油菜的表型遗传机制,为培育更高商业价值的油菜提供了新方法。

  • 研究结果:

1. 研究组装出黑籽(ZY821)和黄籽(GH06)油菜的高质量基因组,并发现基因组组装长度的差异主要是由着丝粒和端粒重复序列组装的差异造成的。

2. 通过候选基因挖掘鉴定,发现BnA09MYB47a是种皮色素沉着的关键调控因子,是培育优质油菜的候选基因。


油菜组装基因组的比较

图片9.png

HIC.png




示例二

图片11.png期刊:Global Change Biology           影响因子:10.8           发表时间:2024

本研究基于HIFI+HiC组装技术以及转录组、全基因组重测序数据和生理表型数据,首次系统分析了腹足类短滨螺(Littorina brevicula)的系统发育模式、热敏感性和遗传分化,为理解气候变化对生物分布的影响提供了更加全面的见解。

  • 研究结果:

1.本研究组装了一个高质量的短滨螺基因组,为后续探究与温度适应相关的遗传变异打下了坚实的基础

2.建立了基于生理和遗传性状的机理性物种分布模型来预测不同遗传亚群在气候变化下的分布

图片12.png

短滨螺基因组组装


部分凌恩客户文章


发表时间

文章标题

杂志名

影响因子

合作单位

2023

Comparative genomic analyses reveal the genetic basis of the yellow-seed trait in Brassica napus

Nature Communications

16.6

西南大学

2024

Genomics-Informed Range Predictions Under Global Warming Reveal Reduced Adaptive Diversity Whilst Buffering Range Shifts for a Marine Snail

Global Change Biology

10.8

中国海洋大学水产学院

2023

A near complete genome assembly of chia assists in identification of key fatty acid desaturases in developing seeds

Frontiers in Plant Science

5.6

中科院分子植物科学卓越中心

2025

The Distribution and Dispersal of Large Haploblocks in a Superspecies

Molecular Ecology

4.5

哥伦比亚大学

2023

The completed genome sequence of Pestalotiopsis versicolor, a pathogenic ascomycete fungus with implications for bayberry production

Genomics

4.4

浙江省农业科学院


电 话:13032137192

邮 箱:lab@biozeron.com


上海凌恩生物科技有限公司(简称“凌恩生物”)成立于2014年,是一家从事组学科研技术服务的高新技术企业。凌恩生物拥有完备的组学测序技术平台,业务板块涉及组学研究的多个领域方向。截至2024年,凌恩生物已成立分公司或分支机构6家,服务范围辐射全球。

       以打造高品质测序及生物信息分析研发服务团队为目标,凌恩生物注重创新、时刻关注科研需求,先后研发了包括eDNA Metabarcoding,宏基因组元素循环分析,宏基因组抗性基因分析,高宿主污染去除宏基因组,宏转录组在内的微生态系列特色产品,备受广大科研工作者关注。凌恩技术团队参与的项目成果也多次发表在《Nature》《Cell》《PNAS》等国际高端学术期刊上秉持专业务实,追求卓越的理念,凌恩生物将满怀信心、迎接挑战,坚持应用新技术,研发新产品,助力科研。

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