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产品介绍


QTL定位——数量性状在遗传上是由很多基因控制的,很大程度上受环境因素影响,控制数量性状的主效基因位点称为QTLQuantitative Trait Locus)。QTL定位就是确定数量性状基因在染色体上的位置的方法。

微卫星标记(Microsatellite)也称为SSR,是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。使用全基因组低深度测序,可以在基因组序列中迅速鉴定SSR序列,并进行批量引物设计,用于SSR标记开发。

单核苷酸多态性(SNP,是基因组水平上由单个核苷酸变异所引起的DNA序列多态性,广泛存在于基因组种,可作为重要的分子标记应用于医学及农业研究。

简化基因组测序技术利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点并进行酶切反应,然后对酶切获得的Tag序列进行高通量测序可快速开发出成千上万的SNPSSR分子标记,用于分子标记开发、群体遗传分析、遗传图谱构建、QTL定位、全基因组关联分析、群体研究与分子育种领域等等。



技术流程





技术优势


  • 微量建库技术,DNA总量只需2ug即可,流程优化,项目周期显著降低;
  • 稳定可靠,已开展简化基因组样本数十万余例
  • 团队人员稳定,项目经验丰富,核心技术人员均9年以上从业经验,经验丰富创新性强,可提供个性化分析服务
  • 流程优化,项目周期显著降低;
  • 结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本;
  • 提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。



送样要求


样品类型样品材料或者DNA
DNA总量2ug
DNA浓度≧30ng/ul




分析示例


群落structure


SNP突变频谱


性状相关侯选区域鉴定


遗传图谱连锁群


性状关联分析



项目经验

1. Bi-directional selection in upland rice leads to its adaptive differentiation from lowland rice in drought resistance and productivity.Molecular Plant(IF=9.326), 2019.

2. Long-read genome assembly and genetic architecture of fruit shape in the bottle gourd .The Plant Journal (IF=6.417),2021

3. Mapping Floral Genetic Architecture in Prunus mume, an Ornamental Woody Plant.Frontiers in Plant Science(IF=5.753),2022

4. Functional physiological phenotyping with functional mapping: A general framework to bridge the phenotype-genotype gap in.iScience(IF=5.458),2021

5. Dissecting Genetic Basis of Deep Rooting in Dongxiang Wild Rice. Rice Science(IF=4.412),2022

6. Construction of high-density linkage maps and QTL mapping for growth-related traits in F1 hybrid Yunlong grouper.Aquaculture(IF=4.242),2021


关于我们

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上海凌恩生物科技有限公司2014年成立于上海,是一家从事生物科研技术服务的高科技公司,专注于二代高通量测序与三代单分子测序服务在科研与人类健康领域的应用和研究。

       公司以北京大学、南京大学以及中国科学院等国内外高等院校与科研院所的专家教授作为技术依托,吸纳多名在生物信息高级技术人员的加盟,参与并完成多个高科技 项目。目前的研究成果发表在Nature、Cell、PNAS等国际顶尖学术期刊。随着二代测序的普及和三代测序的方兴未艾,上海凌恩以打造国内一流测序服务与试剂研发服务团队为目标,努力推进我国的基因组学科研与其在人类健康与农业领域的深度应用与发展。




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