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蛋白质组

高通量蛋白质组分析,也称为鸟枪法质谱分析(shotgun),是对遗传背景类似的2个或多个样本之间、在全蛋白质组层面上开展蛋白质表达水平的质谱定量分析方法。根据是否引入对蛋白或多肽的标记与否,可分为基于稳定同位素标记的定量蛋白质组学分析,包括iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组学、SILAC标记定量蛋白质组学、二甲基标记定量蛋白质组学,以及不依赖于标记技术的非标(Label-free)定量蛋白质组学。蛋白质是生物表型和疾病发生的直接功能分子。因此在全蛋白质组层面上开展高通量定量蛋白质表达谱分析对于揭示各种生物学现象和疾病发生、发展机理不仅有着重要的理论意义,对于以蛋白质生物标志物的鉴定、蛋白质药物靶点的筛选也有着重大的现实意义。


人体细胞中估计蛋白总数约为18,000~20,000个。传统的基于2D双向电泳分离的蛋白质组通常可以鉴定出约1,000种蛋白,常规的基于酶解多肽的shutgun蛋白质组学分析方法约能鉴定3,000~4,000个蛋白,对全蛋白质组的覆盖仅在5~20%左右,远远不能满足高通量定量蛋白质表达谱分析的要求。结合超高分辨率、高灵敏度的液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)、精细的样品制备与蛋白分离方法,凌恩生物在细胞与组织类样品中可鉴定直至超过10,000个蛋白,全蛋白质组的覆盖>60%,结合高级生物信息学分析,构建高通量定量蛋白质表达谱乃至物种的蛋白质组草图,从而引领进入“蛋白质学时代”。

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