凌恩生物
Biozeron

021-31021022 ;15850554146
GBS文库构建
RAD文库构建

产品介绍

GBSGenotyping-by-Sequencing是指通过测序进行基因分型,其命名是为了与传统的通过芯片进行基因分型的方法相区别是一种常见的简化基因组测序技术其原理是将基因组DNA进行酶切,然后对酶切片段两端序列进行高通量测序。通过分析获得SNP信息并进行基因分型,是一种快速、简便、低成本的基因分型方法,适合对大规模样品进行标记筛选。

GBS技术可以根据研究目的灵活调整所需捕获酶切位点的片段数(Tags),从而控制捕获序列的范围。基于简化基因组技术(GBS)的遗传图谱构建,能够降低基因组的复杂度,数据量低,操作简便,节约成本,特别适合大样本量研究。玉米、木薯、枣树等物种都已成功运用GBS技术构建了高密度遗传图谱,为进一步进行目标性状定位、分子辅助选择和图位克隆重要农艺性状基因奠定了基础。



技术流程

GBS文库构建流程图.png


技术原理

1)将不同样本和含不同barcode接头成对放在平板里;

2)使用ApeKI限制酶进行酶解;

3)使用T4连接酶,将接头连接到片段两端因酶切产生的粘末端(stcky end);

4)将含不同barcode的样本混池,随后过片段长度筛选柱,过滤尚未反应的接头;

5)加入PCR引物,进行PCR扩增。

GBS技术原理图.png



技术优势

  • 物种适用范围广有无参考基因组均可进行研究

  • 投入低研究所需数据量低,适合对超大大样本量研究

  • 周期短2-4个月即可获得相关结果

  • 样品要求量低单个样品DNA送样量低至300ng


送样要求

样品类型:样品材料或者DNA

DNA总量:1ug

DNA浓度:≧30ng/ul


分析示例

1

群落structure

群落structure.png


2

SNP突变频谱

SNP突变频谱.png


3

性状相关侯选区域鉴定

性状相关侯选区域鉴定.png



4

遗传图谱连锁群

遗传图谱连锁群.png


5

性状关联分析

性状关联分析.png


产品介绍

RADseqRestriction-site associated DNA sequencing是在第二代测序基础上发展而来的一项基于全基因组酶切位点的简化的基因组测序技术,是简化基因组测序技术的总称。RADseq大幅降低基因组的复杂度,降低建库和测序成本,操作简便,同时不受参考基因组的限制,可快速鉴定出高密度的SNP位点,实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测,一次测序即可获得数以万计的多态性遗传标记。

RAD-Seq尤其适合于大样本量的研究,可以为利用全基因组重测序技术做深度信息挖掘奠定坚实的基础。与传统芯片分型技术相比,RAD-Seq可以检测基因组上未知变异点中新的SNP,发掘新的和稀有的变异。RAD-Seq技术可广泛应用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化等研究,为后续揭示进化关系、功能基因挖掘等提供理论基础,具有重大的科研和产业价值。


   

技术流程

RAD文库构建技术流程.png


送样要求

样品类型:样品材料或者DNA

DNA总量:1ug

DNA浓度:≧30ng/ul



技术优势

  • 大型动植物基因组分析经验丰富,核心技术人员均9年以上项目经验,已发表国际高水平基因组文章20余篇,获得包括中国科学院、中国农业科学院等在内的多家顶级研究机构认可

  • 合理的团队资源配置,完整的基因组学分析整合,可提供包括基因组、转录组、表观遗传学在内的多种组学技术服务及多种高级及定制化组学分析方案。

  • 流程优化,项目周期显著降低;

  • 结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本;

  • 提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。


示例分析

1

群落structure

RAD文库构建群落structure.png


2

SNP突变频谱

RAD文库构建SNP突变频谱.png


3

性状相关侯选区域鉴定

RAD文库构建性状相关侯选区域鉴定.png


4

遗传图谱连锁群

RAD建库遗传图谱连锁群.png


5

性状关联分析

RAD建库性状关联分析.png


     

     

      上海凌恩生物科技有限公司2014年成立于上海,是一家从事生物科研技术服务的高科技公司,专注于二代高通量测序与三代单分子测序服务在科研与人类健康领域的应用和研究。

      公司以北京大学、南京大学以及中国科学院等国内外高等院校与科研院所的专家教授作为技术依托,吸纳多名在生物信息高级技术人员的加盟,参与并完成多个高科技 项目。目前的研究成果发表在Nature、Cell、PNAS等国际顶尖学术期刊。随着二代测序的普及和三代测序的方兴未艾,上海凌恩以打造国内一流测序 服务与试剂研发服务团队为目标,努力推进我国的基因组学科研与其在人类健康与农业领域的深度应用于发展。

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